Genetic evidence for multiple paternity in the critically endangered Cuban crocodile (Crocodylus rhombifer)
Notice bibliographique
Résumé
Conservation strategies can be most effective when factors influencing the persistence of populations are well-understood, including aspects of reproductive biology such as mating system. Crocodylians have been traditionally associated with a polygynous mating system, with genetic studies revealing multiple paternity of clutches in several species. The endemic Cuban crocodile, Crocodylus rhombifer , is currently listed as Critically Endangered, and is one of the least understood crocodylian species in terms of its mating behavior. Here, we tested a hypothesis of multiple paternity in the Cuban crocodile by collecting genotypic data at nine microsatellite loci for 102 hatchlings from five nests sampled at the Zapata Swamp captive breeding facility and analyzing them in relation to data previously collected for 137 putative parents. All five nests showed evidence of multiple paternity based on the numbers of alleles per locus, with sibship analyses reconstructing all nests as having four to six full-sib family groups. Accordingly, mean pairwise relatedness values per nest ranged from 0.21 to 0.39, largely intermediate between theoretical expected values for half-siblings (0.25) and full-siblings (0.50). It is not possible to differentiate whether the multiple paternity of a nest was due to multiple matings during the same breeding season, or a result of sperm storage. Our results reveal that the C. rhombifer mating system is likely best characterized as promiscuous and suggest that the standard practice of enforcing a 1:2 sex ratio at the captive breeding facility should be altered in order to better maintain a demographically and genetically healthy ex situ population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».