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Enregistrement W2510218025 · doi:10.1096/fasebj.30.1_supplement.911.5

Variation in <i>ALDH4A1</i> , Proline Intake and Plasma Proteins in a Population of Young Adults

2016· article· en· W2510218025 sur OpenAlexafffundabout
Joseph Jamnik, Mun Heui Kim, Christoph H. Borchers, Ahmed El‐Sohemy

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensGenome British ColumbiaUniversity of VictoriaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesAdvanced Foods and Materials Network
Mots-clésProlineSingle-nucleotide polymorphismBiologyPopulationEndocrinologyGeneticsInternal medicineMedicinePhysiologyGeneGenotypeAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background The effects of dietary proline content on the lifespan of Caenorhabditis elegans have recently been shown to differ between wild‐type strains and those with a mutation in alh‐6 , a gene involved in proline metabolism. However, this association has not been examined in humans. Objective The objective was to determine whether there is an interaction between dietary proline intake and common genetic variations in the ALDH4A1 gene, the human ortholog of alh‐6 , on proteomic biomarkers in humans. Methods Subjects were Caucasian participants of the Toronto Nutrigenomics and Health Study (n=488), a cross sectional examination of young adults aged 20–29 years. Dietary proline intake was estimated using a 196‐item semi‐quantitative food frequency questionnaire. A panel of 54 plasma proteins that become dys regulated during the progression of many chronic conditions were measured using a multiple reaction monitoring HPLC‐MS/MS assay. Two single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the ALDH4A1 gene (rs9117 and rs4912075) were genotyped and the association between these SNPs and the plasma proteome was examined using general linear models (GLMs) adjusted for age, sex, BMI and hormonal contraceptive use among women. GLMs were then used to determine whether stratification by the median value of energy‐adjusted proline intake modified any observed associations. Results There was a significant interaction (p<0.05) between ALDH4A1 variant rs4917025 and proline intake on circulating levels of apolipoprotein I and histidine‐rich glycoprotein, as well as an interaction between rs9117 and proline intake on concentrations of apolipoprotein D, zinc‐α 2 ‐glycoprotein and serum amyloid P‐component (p<0.05). Conclusion These results indicate that genetic variation in ALDH4A1 may interact with dietary proline intake in humans to influence concentrations of various proteomics biomarkers of health. Support or Funding Information Research support from the Advanced Foods and Materials Network.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,038

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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