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Enregistrement W2510869665 · doi:10.1016/j.bbrep.2016.08.012

High-throughput flow cytometry screening of human hepatocellular carcinoma reveals CD146 to be a novel marker of tumor-initiating cells

2016· article· en· W2510869665 sur OpenAlexafffund
Kui Chen, Avrilynn Ding, Yu Ding, Anand Ghanekar

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Biophysics Reports · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCancer Research Society
Mots-clésCD146Hepatocellular carcinomaFlow cytometryCirculating tumor cellCancer researchThroughputBiologyMolecular biologyCancerCell biologyGeneticsStem cellComputer scienceMetastasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hepatocellular carcinoma (HCC) remains a common and lethal cancer. Cancer stem cells, or tumor-initiating cells (TICs), are thought to contribute to the pathogenesis of HCC, but remain to be fully characterized. Unbiased screens of primary human HCC cells for the identification of novel HCC TIC markers have not been reported. We conducted high-throughput flow cytometry (HT-FC) profiling to characterize the expression of 375 CD antigens on tumor cells from 10 different human HCC samples. We selected 91 of these for further analysis based on HT-FC data that showed consistent expression in discrete, rare, sortable populations of HCC cells. Nine of these CD antigens demonstrated significantly increased expression in the EpCAM+ stem/progenitor fraction of a human HCC cell line and were further evaluated in primary human HCC tissues from 30 different patients. Of the nine tested, only CD146 demonstrated significantly increased expression in HCC tumor tissue as compared with matched adjacent non-tumor liver tissue. CD146+CD31−CD45− cells purified from HCC tumors and cell lines demonstrated a unique phenotype distinct from mesenchymal stem cells. As compared with other tumor cell fractions, CD146+CD31−CD45− cells showed significantly increased colony-forming capacity in vitro, consistent with TICs. This study demonstrates that HT-FC screening can be successfully applied to primary human HCC and reveals CD146 to be a novel TIC marker in this disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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