MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2511020653 · doi:10.1128/aac.01359-16

Results from the Canadian Nosocomial Infection Surveillance Program on Carbapenemase-Producing <i>Enterobacteriaceae</i> , 2010 to 2014

2016· article· en· W2511020653 sur OpenAlexaffabout
Laura Mataseje, Kahina Abdesselam, Julie Vachon, Robyn Mitchel, Elizabeth Bryce, Diane Roscoe, David A. Boyd, Joanne Embreé, Kevin Katz, Pamela Kibsey, Andrew E. Simor, Geoffrey Taylor, Nathalie Turgeon, Joanne M. Langley, Denise Gravel, Kanchana Amaratunga, Michael R. Mulvey

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensHôtel-Dieu de QuébecVictoria General HospitalSunnybrook Health Science CentreNorth York General HospitalIzaak Walton Killam Health CentreUniversity of ManitobaAlberta Hospital EdmontonHealth Sciences CentreVancouver General HospitalUniversity of Alberta HospitalPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCarbapenem-resistant enterobacteriaceaeMultilocus sequence typingEnterobacteriaceaeInfection controlMedicineIncidence (geometry)Clinical microbiologyMicrobiologyAntimicrobial stewardshipTypingInternal medicineBiologyGenotypeAntibiotic resistanceIntensive care medicineAntibioticsEscherichia coliGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) are increasing globally; here we report on the investigation of CPE in Canada over a 5-year period. Participating acute care facilities across Canada submitted carbapenem-nonsusceptible Enterobacteriaceae from 1 January 2010 to 31 December 2014 to the National Microbiology Laboratory. All CPE were characterized by antimicrobial susceptibilities, pulsed-field gel electrophoresis, multilocus sequence typing, and plasmid restriction fragment length polymorphism analysis and had patient data collected using a standard questionnaire. The 5-year incidence rate of CPE was 0.09 per 10,000 patient days and 0.07 per 1,000 admissions. There were a total of 261 CPE isolated from 238 patients in 58 hospitals during the study period. bla KPC-3 (64.8%) and bla NDM-1 (17.6%) represented the highest proportion of carbapenemase genes detected in Canadian isolates. Patients who had a history of medical attention during international travel accounted for 21% of CPE cases. The hospital 30-day all-cause mortality rate for the 5-year surveillance period was 17.1 per 100 CPE cases. No significant increase in the occurrence of CPE was observed from 2010 to 2014. Nosocomial transmission of CPE, as well as international health care, is driving its persistence within Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,985
Score d'incertitude au seuil0,117

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAntimicrobial Agents and ChemotherapyMême sujetAntibiotic Resistance in BacteriaTravaux en français237 207