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Enregistrement W2511323040 · doi:10.1093/eep/dvw018

Adolescent epigenetic profiles and environmental exposures from early life through peri-adolescence

2016· article· en· W2511323040 sur OpenAlexaff
Jaclyn M. Goodrich, Dana C. Dolinoy, Brisa N. Sánchez, Zhenzhen Zhang, John D. Meeker, Adriana Mercado‐García, Maritsa Solano-González, Howard Hu, Martha María Téllez‐Rojo, Karen E. Peterson

Notice bibliographique

RevueCurrent Zoology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueHealth, Environment, Cognitive Aging
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institutes of HealthU.S. Environmental Protection Agency
Mots-clésPhthalateEpigeneticsDNA methylationBenzhydryl compoundsBiomarkerOffspringMethylationUrineEpigenomePhysiologyUrinary systemPeriBiologyPregnancyGeneticsMedicineInternal medicineGeneBisphenol AEndocrinologyChemistryGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epigenetic perturbations induced by environmental exposures at susceptible lifestages contribute to disease development. Even so, the influence of early life and ongoing exposures on the adolescent epigenome is rarely examined. We examined the association of exposure biomarkers for lead (Pb), bisphenol A (BPA), and nine phthalates metabolites with blood leukocyte DNA methylation at LINE-1 repetitive elements and environmentally responsive genes ( IGF2 , H19 , and HSD11B2 ) in peri-adolescents. Participants ( n = 247) from the Early Life Exposures in Mexico to Environmental Toxicants (ELEMENT) birth cohorts were followed-up once between the ages of 8 and 14 years, and concurrent exposures were measured in biospecimen collected at that time (blood Pb, urinary BPA, and phthalate metabolites). Prenatal and childhood exposures to Pb were previously approximated using maternal and child samples. BPA and phthalate metabolites were measured in third trimester maternal urine samples. Significant associations ( P < 0.05) were observed between DNA methylation and exposure biomarkers that were gene and biomarker specific. For example, Pb was only associated with LINE-1 hypomethylation during pregnancy ( P = 0.04), while early childhood Pb was instead associated with H19 hypermethylation ( P = 0.04). Concurrent urinary mono (2-ethylhexyl) phthalate (MEHP) was associated with HSD11B2 hypermethylation ( P = 0.005). Sex-specific associations, particularly among males, were also observed. In addition to single exposure models, principal component analysis was employed to examine exposure mixtures. This method largely corroborated the findings of the single exposure models. This study along with others in the field suggests that environment-epigenetic relationships vary by chemical, exposure timing, and sex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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