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Enregistrement W2511449838 · doi:10.1186/s12879-016-1741-6

False Negative Results in Clostridium difficile Testing

2016· article· en· W2511449838 sur OpenAlexaff
Yanal Murad, Justo Perez, Gustavo Ybazeta, Sarah Mavin, Sebastien Lefebvre, J. Scott Weese, Joyce D. Rousseau, Francisco Díaz‐Mitoma, Reza Nokhbeh

Notice bibliographique

RevueBMC Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensHealth Sciences NorthUniversity of GuelphNOSM University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedical microbiologyClostridium difficileParasitologyMedicineMicrobiologyClostridiumFalse Negative ReactionsClostridium InfectionsBiologyPathologyInternal medicineAntibioticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Accurate diagnosis of Clostridium difficile infection (CDI) is paramount for patient management. The wrong diagnosis places patients at risk, delays treatment, and/ or contributes to transmission of infection in the healthcare setting. Although amplification of the toxin B gene by polymerase chain reaction (PCR) is a sensitive method for detecting toxigenic C. difficile, false negative results still occur and could impact the diagnosis and treatment of this infection. METHODS: This study investigated 48 patients that tested negative for toxigenic C. difficile via GeneXpert C. difficile epi test, while simultaneously testing positive for toxigenic C. difficile via stool culture. Fifty discrepant samples were collected over a 15-month period and all C. difficile isolates were characterized by ribotype. Patient charts were reviewed to assess whether discrepant results impacted the treatment course or clinical outcome of affected patients. RESULTS: Fifty samples of a total of 2308 samples tested in an acute healthcare facility over a 15-month period had negative PCR and positive stool culture for toxigenic C. difficile. C. difficile isolated from the discrepant samples resulted in diverse ribotyping patterns suggesting they were derived from different strains. The samples belonged to patients who were distributed evenly between age groups and wards in the hospital. In the majority of cases, the false negative C. difficile test results did not seem to impact the clinical outcome in these patients. CONCLUSIONS: The PCR limit of detection may impact the results of molecular methods for C. difficile detection. Both clinical and analytical sensitivity of C. difficile tests should be considered when deciding which diagnostic assay to use, and clinical correlates should be examined carefully before excluding CDI as a cause of disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,152
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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