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Enregistrement W2511945421 · doi:10.1093/hmg/ddw278

Effect of genetic background on the phenotype of the<i>Smn<sup>2B/-</sup></i>mouse model of spinal muscular atrophy

2016· article· en· W2511945421 sur OpenAlexafffund
Mehdi Eshraghi, Emily McFall, Sabrina Gibeault, Rashmi Kothary

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCure SMAMuscular Dystrophy Association
Mots-clésSpinal muscular atrophySMN1SMA*BiologyCongenicPhenotypeMotor neuronAtrophyPathologyRatónEndocrinologySpinal cordGeneGeneticsNeuroscienceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spinal muscular atrophy (SMA) is caused by mutations or deletions in the Survival Motor Neuron 1 (SMN1) gene in humans. Modifiers of the SMA symptoms have been identified and genetic background has a substantial effect in the phenotype and survival of the severe mouse model of SMA. Previously, we generated the less severe Smn2B/- mice on a mixed genetic background. To assess the phenotype of Smn deficiency on a pure genetic background, we produced Smn2B/2B congenic mice on either the C57BL/6 (BL6) or FVB strain background and characterized them at the 6th generation by breeding to Smn+/- mice. Smn2B/- mice from these crosses were evaluated for growth, survival, muscle atrophy, motor neuron loss, motor behaviour, and neuromuscular junction pathology. FVB Smn2B/- mice had a shorter life span than BL6 Smn2B/- mice (median of 19 days vs. 25 days). Similarly, all other defects assessed occurred at earlier stages in FVB Smn2B/-mice when compared to BL6 Smn2B/-mice. However, there were no differences in Smn protein levels in the spinal cords of these mice. Interestingly, levels of Plastin 3, a putative modifier of SMA, were significantly induced in spinal cords of BL6 Smn2B/- mice but not of FVB Smn2B/-mice. Our studies demonstrate that the phenotype in Smn2B/-mice is more severe in the FVB background than in the BL6 background, which could potentially be explained by the differential induction of genetic modifiers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,639

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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