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Enregistrement W2512423205 · doi:10.5539/jas.v8n9p217

Detection of Emerging Food Pathogens in Chicken Meat Using Multiplex Polymerase Chain Reaction

2016· article· en· W2512423205 sur OpenAlexvenueno aff
Appa Rao, N Nagendra Babu, Thamizhannal Thamizhannal

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCampylobacter jejuniDNA extractionCampylobacterAgarose gel electrophoresisListeria monocytogenesPolymerase chain reactionMultiplex polymerase chain reactionBiologyCampylobacter coliListeriaMolecular biologyMicrobiologyDNABacteriaGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A study was undertaken to develop a multiplex PCR (m-PCR) protocol for simultaneous detection of Campylobacter jejuni and Listeria monocytogenes in chicken meat. The extraction of DNA was carried out using commercial DNA extraction kit, Phenol Chloroform and boiling method. Samples with OD ratio (260:280) between 1.7 and 1.9 were considered good in terms of concentration and purity and were used for PCR amplification. DNA extraction kit and Phenol Chloroform method revealed good OD value were used for sample extraction process. PCR and m-PCR amplification was carried out using genus specific primers were designed by targeting its Hyp (500 bp) and prfA (290 bp) gene for Campylobacter jejuni and Listeria monocytogenes respectively. Electrophoresis of amplified PCR products and gel documentation revealed 500 bp and 290 bp in 2% Agarose. The multiplex PCR technique was standardized using the reference strains with the similar amplification procedure. The minimum detection level (sensitivity) by mPCR for Campylobacter jejuni and Listeria monocytogenes was found to be 0.2 ng/ul and 1.0 ng/ul of DNA in a reaction mixture (25 ul). The developed multiplex PCR technique could detect Campylobacter jejuni and Listeria monocytogenes upto 3 × 105 and 3 × 104 CFU/ml of artificially inoculated meat homogenate. Around 60 chicken meat samples were collected from different regions of chennai and were screened for the presence of Campylobacter jejuni and Listeria monocytogenes. All the samples screened were not positive either for Campylobacter jejuni and Listeria monocytogenes. The negative samples were further checked by culture methods and good correlation between these two methods was observed. Hence, the m-PCR technique developed in this study can be used as a rapid screening test for detection of Campylobacter jejuni and Listeria monocytogenes from chicken meat within 24 hours.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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