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Enregistrement W2513036042 · doi:10.21873/anticanres.11017

Tissue Microarray Is a Reliable Tool for the Evaluation of HER2 Amplification in Breast Cancer

2016· article· en· W2513036042 sur OpenAlexafffund
Daniela Furrer, Simon Jacob, Chantal Caron, François Sanschagrin, Louise Provencher, Caroline Diorio

Notice bibliographique

RevueAnticancer Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensHôpital du Saint-SacrementUniversité Laval
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéFondation du cancer du sein du QuébecUniversité Laval
Mots-clésConcordanceTissue microarrayBreast cancerFluorescence in situ hybridizationGene duplicationOncologyPathologyCancerMicroarrayMedicineBiopsyInternal medicineBiologyGeneGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: We examined an economical method for evaluating the amplification of the human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) gene in breast cancer specimens. MATERIALS AND METHODS: We compared HER2 amplification determined by fluorescence in situ hybridization (FISH) on whole-tissue (WT) blocks used for diagnostic and on tissue microarray (TMA) sections for a cohort of 521 consecutive patients with breast cancer. In a subset of 116 patients, we examined HER2 concordance from the WT section and a TMA section from a randomly chosen additional block (a proxy of the core biopsy). RESULTS: Overall concordance for HER2 amplification between WT and TMA sections was 98.2%, and between sections from WT and from the additional block was 99.0%. CONCLUSION: The high concordance rates support the use of TMA for the evaluation of HER2 amplification in breast cancer and suggest that FISH can be used to assess HER2 using core biopsies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,237
Tête enseignante GPT0,540
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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