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Enregistrement W2513184125 · doi:10.1016/j.jaci.2016.06.021

Clinical spectrum and features of activated phosphoinositide 3-kinase δ syndrome: A large patient cohort study

2016· article· en· W2513184125 sur OpenAlexfundno aff
Tanya Coulter, Anita Chandra, Chris M. Bacon, Judith Babar, James Curtis, Nick Screaton, John R. Goodlad, George E. Farmer, Cathal Steele, Timothy Ronan Leahy, Rainer Döffinger, Helen Baxendale, Jolanta Bernatoniene, David Edgar, Hilary Longhurst, Stephan Ehl, Carsten Speckmann, Bodo Grimbacher, Anna Šedivá, Tomáš Milota, Saul N. Faust, Anthony P. Williams, Grant Hayman, Zeynep Yesim Kucuk, Rosie Hague, Paul French, Richard Brooker, Peter Forsyth, Richard Herriot, Caterina Cancrini, Paolo Palma, Paola Ariganello, Niall Conlon, Conleth Feighery, Patrick J. Gavin, Alison Jones, Kohsuke Imai, Mohammad A. A. Ibrahim, Gašper Markelj, Mario Abinun, Frédéric Rieux‐Laucat, Sylvain Latour, Isabelle Pellier, Alain Fischer, Fabien Touzot, Jean‐Laurent Casanova, Anne Durandy, Siobhan O. Burns, Sinisa Savic, Dinakantha Kumararatne, Despina Moshous, Sven Kracker, Bart Vanhaesebroeck, Klaus Okkenhaug, Capucine Pïcard, Sergey Nejentsev, Alison M. Condliffe, Andrew J. Cant

Notice bibliographique

RevueJournal of Allergy and Clinical Immunology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNIHR Sheffield Biomedical Research CentreNIHR Cambridge Biomedical Research CentreMedical Research CouncilNovartis Institutes for BioMedical ResearchUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustKing's College LondonCentre National de la Recherche ScientifiqueLigue Contre le CancerBundesministerium für Bildung und ForschungCSL BehringNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of CambridgeBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilUniversity College LondonWellcome TrustCancer Research UKImmunodeficiency CanadaFondation ARC pour la Recherche sur le CancerGrifolsAgence Nationale de la RechercheRegeneron PharmaceuticalsJapan Blood Products OrganizationDeutsches Zentrum für InfektionsforschungDeutsche ForschungsgemeinschaftDirectorate for Biological SciencesGlaxoSmithKlinePfizerBiogenEuropean CommissionSanofiBaxaltaGenentechBritish Lung Foundation
Mots-clésCohortMedicinePhosphoinositide 3-kinaseInternal medicinePI3K/AKT/mTOR pathwaySignal transductionBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Activated phosphoinositide 3-kinase δ syndrome (APDS) is a recently described combined immunodeficiency resulting from gain-of-function mutations in PIK3CD, the gene encoding the catalytic subunit of phosphoinositide 3-kinase δ (PI3Kδ). OBJECTIVE: We sought to review the clinical, immunologic, histopathologic, and radiologic features of APDS in a large genetically defined international cohort. METHODS: We applied a clinical questionnaire and performed review of medical notes, radiology, histopathology, and laboratory investigations of 53 patients with APDS. RESULTS: Recurrent sinopulmonary infections (98%) and nonneoplastic lymphoproliferation (75%) were common, often from childhood. Other significant complications included herpesvirus infections (49%), autoinflammatory disease (34%), and lymphoma (13%). Unexpectedly, neurodevelopmental delay occurred in 19% of the cohort, suggesting a role for PI3Kδ in the central nervous system; consistent with this, PI3Kδ is broadly expressed in the developing murine central nervous system. Thoracic imaging revealed high rates of mosaic attenuation (90%) and bronchiectasis (60%). Increased IgM levels (78%), IgG deficiency (43%), and CD4 lymphopenia (84%) were significant immunologic features. No immunologic marker reliably predicted clinical severity, which ranged from asymptomatic to death in early childhood. The majority of patients received immunoglobulin replacement and antibiotic prophylaxis, and 5 patients underwent hematopoietic stem cell transplantation. Five patients died from complications of APDS. CONCLUSION: APDS is a combined immunodeficiency with multiple clinical manifestations, many with incomplete penetrance and others with variable expressivity. The severity of complications in some patients supports consideration of hematopoietic stem cell transplantation for severe childhood disease. Clinical trials of selective PI3Kδ inhibitors offer new prospects for APDS treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations450
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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