MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2513269552 · doi:10.1200/jco.2016.67.3616

Clinical Effects of Driver Somatic Mutations on the Outcomes of Patients With Myelodysplastic Syndromes Treated With Allogeneic Hematopoietic Stem-Cell Transplantation

2016· article· en· W2513269552 sur OpenAlexaff
Matteo Giovanni Della Porta, Anna Gallì, Andrea Bacigalupo, Silvia Zibellini, Massimo Bernardi, Ettore Rizzo, Bernardino Allione, Maria Teresa Van Lint, Pietro Pioltelli, Paola Marenco, Alberto Bosi, Maria Teresa Voso, Simona Sica, Mariella Cuzzola, Emanuele Angelucci, Marianna Rossi, Marta Ubezio, Alberto Malovini, Ivan Limongelli, Virginia Valeria Ferretti, Orietta Spinelli, Cristina Tresoldi, Sarah Pozzi, Silvia Luchetti, Laura Anna Pezzetti, Silvia Catricalà, Chiara Milanesi, Alberto Riva, Benedetto Bruno, Fabio Ciceri, Francesca Bonifazi, Riccardo Bellazzi, Elli Papaemmanuil, Armando Santoro, Emilio Paolo Alessandrino, Alessandro Rambaldi, Mario Cazzola

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensMerck Canada Inc. (Canada)
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteRegione Lombardia
Mots-clésMyelodysplastic syndromesMedicineInternational Prognostic Scoring SystemOncologyHematopoietic stem cell transplantationSomatic cellRUNX1MyeloidInternal medicineMyeloid leukemiaTransplantationGene mutationGermline mutationMutationStem cellHaematopoiesisGeneGeneticsBiologyBone marrow

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The genetic basis of myelodysplastic syndromes (MDS) is heterogeneous, and various combinations of somatic mutations are associated with different clinical phenotypes and outcomes. Whether the genetic basis of MDS influences the outcome of allogeneic hematopoietic stem-cell transplantation (HSCT) is unclear. PATIENTS AND METHODS: We studied 401 patients with MDS or acute myeloid leukemia (AML) evolving from MDS (MDS/AML). We used massively parallel sequencing to examine tumor samples collected before HSCT for somatic mutations in 34 recurrently mutated genes in myeloid neoplasms. We then analyzed the impact of mutations on the outcome of HSCT. RESULTS: Overall, 87% of patients carried one or more oncogenic mutations. Somatic mutations of ASXL1, RUNX1, and TP53 were independent predictors of relapse and overall survival after HSCT in both patients with MDS and patients with MDS/AML (P values ranging from .003 to .035). In patients with MDS/AML, gene ontology (ie, secondary-type AML carrying mutations in genes of RNA splicing machinery, TP53-mutated AML, or de novo AML) was an independent predictor of posttransplantation outcome (P = .013). The impact of ASXL1, RUNX1, and TP53 mutations on posttransplantation survival was independent of the revised International Prognostic Scoring System (IPSS-R). Combining somatic mutations and IPSS-R risk improved the ability to stratify patients by capturing more prognostic information at an individual level. Accounting for various combinations of IPSS-R risk and somatic mutations, the 5-year probability of survival after HSCT ranged from 0% to 73%. CONCLUSION: Somatic mutation in ASXL1, RUNX1, or TP53 is independently associated with unfavorable outcomes and shorter survival after allogeneic HSCT for patients with MDS and MDS/AML. Accounting for these genetic lesions may improve the prognostication precision in clinical practice and in designing clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,309

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations255
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical OncologyMême sujetAcute Myeloid Leukemia ResearchTravaux en français237 207