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Enregistrement W2513927335 · doi:10.1118/1.4961403

A particle filter based autocontouring algorithm for lung tumor tracking using dynamic magnetic resonance imaging

2016· article· en· W2513927335 sur OpenAlexafffund
Alexandra E Bourque, Stéphane Bedwani, Édith Filion, Jean‐François Carrier

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMedical Image Segmentation Techniques
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésContouringArtificial intelligenceThresholdingContext (archaeology)AlgorithmCentroidMagnetic resonance imagingTracking (education)ModelSimFilter (signal processing)Computer scienceMathematicsNuclear medicineComputer visionImage (mathematics)MedicineRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: This study introduces a novel autocontouring algorithm based on particle filter for lung tumors. It is validated on dynamic magnetic resonance (MR) images and is developed in the context of MR-linac treatments. METHODS: A sequential Monte Carlo method called particle filter is used as the main structure of the algorithm and is combined with Otsu's thresholding technique to contour lung tumors on dynamic MR images. Four non-small cell lung cancer (NSCLC) patients were imaged with a 1.5 T MR for 60 s at a rate of 4 images/s and were asked to breathe normally. Prior to treatment, some image processing is required by the proposed algorithm, which includes a manual contour of the tumor, the tumor's displacement, and its descriptive statistics. During treatment, the contours are automatically generated by thresholding around the center of mass of the particles. A comparison with the expert's contours is obtained by calculating the Dice similarity coefficient (DSC), the precision, the recall, the Hausdorff distance, and the difference in centroid positions (Δd). RESULTS: This autocontouring algorithm is independent of pretreatment training and presents continuous adaptability as provided by the nature of particle filters. The number of particles is proportional to the area of the tumor and increases the computational time at a rate of 2 ms for every 500 particles, whereas the contouring step adds a constant 14 ms. The contours' comparison is obtained with a mean DSC of 0.89-0.91, mean precision of 0.88-0.91, mean recall of 0.89-0.95, and mean Δd of 0.6-2.0 mm. CONCLUSIONS: This work presents a proof of concept of a new autocontouring algorithm for NSCLC patients on dynamic MR images. The contours were generated in good agreement with the expert's contours.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil0,511

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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