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Enregistrement W2513929705 · doi:10.1093/ijnp/pyw071

Repression of Astrocytic Connexins in Cortical and Subcortical Brain Regions and Prefrontal Enrichment of H3K9me3 in Depression and Suicide

2016· article· en· W2513929705 sur OpenAlexafffund
Corina Nagy, Susana G. Torres‐Platas, Naguib Mechawar, Gustavo Turecki

Notice bibliographique

RevueThe International Journal of Neuropsychopharmacology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNeuroscienceDepression (economics)Prefrontal cortexPsychologyMedicinePsychiatryCognition

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Major depressive disorder has been associated with dysfunctional astrocytic networks. The underlying causes, extent, and consequences of such dysfunctions remain to be characterized. Astrocyte-astrocyte communication occurs principally through gap junction channels primarily formed by connexin 30 and 43 (CX30 and CX43). We previously reported decreased connexin expression in the prefrontal cortex of depressed suicides. In the present study, we investigated whether these changes are mediated by epigenetic regulation, and expanded gene expression quantifications to other cortical and subcortical regions to assess the regional distribution of connexion disruptions in depressed suicides. Methods: The expression of CX30 and CX43 was measured by real-time PCR in samples of neocortex (Brodmann areas 4 and 17), cerebellar cortex, mediodorsal thalamus, and caudate nucleus of 22 depressed suicides and 22 matched sudden-death controls. Chromatin immunoprecipitation was used to measure enrichment levels of the repressive chromatin mark H3K9me3 in the prefrontal cortex. Results: We found a consistent downregulation of connexin genes in all regions examined, except in the cerebellum where an increase in the expression of CX30 was measured and using chromatin immunoprecipitation we observed an enrichment of H3K9me3 for both Cx30 and Cx43 in the prefrontal cortex. Conclusions: Our study shows widespread astrocytic CX gene repression in depressed suicides that is mediated, at least in part, through epigenetic mechanisms. Taken together, these findings support the notion of widespread cerebral astrocytic dysfunction in major depressive disorder.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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