A supramolecular indicator displacement assay for acetyl amantadine, a proxy biomarker for spermidine/spermine <i>N</i><sup>1</sup>-acetyltransferase (SSAT) activity
Notice bibliographique
Résumé
Acetyl amantadine (AcAm) is produced from amantadine (Am) in vivo upon catalysis by spermidine/spermine N 1 -acetyl transferase (SSAT). SSAT is a biomarker for multiple aggressive cancers, and the analysis of AcAm in urine has been promoted as a proxy measure for the early detection of cancer. We report here the development and optimization of cucurbit[7]uril–dye pair based indicator displacement assay (IDA) for the detection of AcAm in solution. In deionized water, using Rhodamine B as the dye, the limit of detection of AcAm was 0.087 μM with a linear response range from 0 to 1 μM. Using berberine as the dye, the limit of detection was 0.077 μM with the same range of linear response. Our efforts and difficulties in translating this assay to function in human urine are also described. We achieve a partial response of the berberine IDA to the presence of AcAm in urine that has undergone a simple PD-10 desalting step.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».