Borrelia burgdorferi sensu lato genospecies in Ixodes ricinus ticks feeding on passerine birds in southern Norway
Notice bibliographique
Résumé
Birds are increasingly considered important in the global dispersal of tick-borne pathogens. The purpose of this study was to investigate the prevalence of Borrelia burgdorferi sensu lato genospecies in Ixodes ricinus ticks collected on passerine birds from two ornithological stations (Jomfruland and Lista) in southern Norway. In both sampling sites a total of 608 (109 larvae and 499 nymphs) of immature ticks were collected from 157 infested birds representing 26 species. The presence of B. burgdorferi s.l. DNA in ticks was tested using direct PCR amplification of the ospA gene, localized on lp-54 plasmid in B. burgdorferi s.l. genome. Twenty one out of 157 infested (13%) birds carried B. burgdorferi s.l. infected Ixodes ricinus ticks. B. burgdorferi s.l. DNA was detected in 19.7% of the tick samples. In total, 6.4% of larvae (7/109) and 10% of nymphs (50/499) were positive. The vast majority of infected ticks were found on blackbird (Turdus merula). The most frequent genospecies was B. garinii (85.5%), followed by B. afzelii (9.0%) and B. valaisiana (5.5%). Five different B. garinii genotypes were identified. Our findings showed that the blackbirds may support the circulation and spread of B. garinii and B. valaisiana. B. garinii was not detected in questing ticks from investigated locations. B. afzelii genospecies, however, dominated in questing ticks, rodents and ticks from rodents.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».