MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2515108670 · doi:10.1021/acs.biochem.6b00615

Solution Structures of Phenol-Soluble Modulins α1, α3, and β2, Virulence Factors from <i>Staphylococcus aureus</i>

2016· article· en· W2515108670 sur OpenAlexafffund
Kaitlyn M. Towle, Christopher T. Lohans, Mark Miskolzie, Jeella Z. Acedo, Marco J. van Belkum, John C. Vederas

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Innovates - Health Solutions
Mots-clésStaphylococcus aureusVirulenceMicrobiologyChemistryPhenolStaphylococcal infectionsStaphylococcusBiologyBacteriaBiochemistryOrganic chemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phenol-soluble modulins (PSMs) are peptide virulence factors produced by staphylococci. These peptides contribute to the overall pathogenicity of these bacteria, eliciting multiple immune responses from host cells. Many of the α-type PSMs exhibit cytolytic properties and are able to lyse particular eukaryotic cells, including erythrocytes, neutrophils, and leukocytes. In addition, they also appear to contribute to the protection of the bacterial cell from the host immune response through biofilm formation and detachment. In this study, three of these peptide toxins, PSMs α1, α3, and β2, normally produced by Staphylococcus aureus, have been synthesized using solid-supported peptide synthesis (SPPS) (PSMα1 and PSMα3) or made by heterologous expression in Escherichia coli (PSMβ2). Their three-dimensional structures were elucidated using nuclear magnetic resonance spectroscopy. PSMα1 and PSMα3 each consist of a single amphipathic helix with a slight bend near the N- and C-termini, respectively. PSMβ2 contains three amphipathic helices, which fold to produce a "v-like" shape between α-helix 2 and α-helix 3, with α-helix 1 folded over such that it is perpendicular to α-helix 3. The availability of three-dimensional structures permits spatial analysis of features and residues proposed to control the biological activity of these peptide toxins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,795

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiochemistryMême sujetAntimicrobial Resistance in StaphylococcusTravaux en français237 207