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Enregistrement W2516033135 · doi:10.1021/acs.jafc.6b02751

Site Directed Mutagenesis of Dextransucrase DsrM from <i>Weissella cibaria</i>: Transformation to a Reuteransucrase

2016· article· en· W2516033135 sur OpenAlexafffund
Michael G. Gänzle

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural and Food Chemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesChina Scholarship CouncilAlberta Livestock and Meat Agency
Mots-clésDextransucraseChemistrySite-directed mutagenesisMutagenesisWeissellaTransformation (genetics)BiochemistryMutationBiologyGeneGeneticsFermentationLeuconostoc mesenteroidesBacteriaLeuconostoc

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glucansucrases produce α-glucans and gluco-oligosaccharides; the linkage type and molecular weight of glucans impacts their functionality. This study compared the catalytic specificities of dextransucrase DsrM from Weissella cibaria 10M and derivatives of this enzymes with GtfA from Lactobacillus reuteri TMW1.656. The N-variable region, which is dispensable for GtfA activity, was essential for DsrM activity. Parallel amino acid substitutions in DsrM-ΔS and GtfA-ΔN indicated that the acceptor binding site residues determining the linkage type differ in these enzymes. DsrM-V583P:V586I had comparable enzyme activity as the respective GtfA derivative but did not increase the proportion of α-(1→4) linkages. DsrM-S622N had low enzyme activity and an unaltered proportion of α-(1→4) linkages while the analogous GtfA-S1062N maintained enzyme activity but increased the proportion of α-(1→4) linkages. This study of dextransucrase from Weissella spp. thus elucidated differences between glucansucrases and will facilitate study of the structure-function relationships of dextran and isomalto-oligosaccharides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,273

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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