MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2516162343 · doi:10.1101/069161

ARGLU1 is a Glucocorticoid Receptor Coactivator and Splicing Modulator Important in Stress Hormone Signaling and Brain Development

2016· preprint· en· W2516162343 sur OpenAlexafffund
Lilia Magomedova, Jens Tiefenbach, Emma Zilberman, Véronique Voisin, Mélanie Robitaille, Serge Gueroussov, Manuel Irimia, Debashish Ray, Rucha Patel, Changjiang Xu, Pancharatnam Jeyasuria, Gary D. Bader, Timothy R. Hughes, Henry M. Krause, Benjamin J. Blencowe, Stéphane Angers, Carolyn L. Cummins

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2016
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of TorontoJ.P. Bickell FoundationUniversity of Pittsburgh
Mots-clésGlucocorticoid receptorGlucocorticoidBiologyGene knockdownRNA splicingAlternative splicingCoactivatorCell biologyGlutamate receptorTranscription factorInternal medicineEndocrinologyNeuroscienceGeneReceptorRNAGeneticsMedicineExon

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Prolonged exposure to glucocorticoid stress hormones precipitates mood and cognitive disorders. We identified arginine and glutamate rich 1 (ARGLU1) in a screen for new modulators of glucocorticoid signaling in the CNS. Biochemical studies found that the glutamate rich C-terminus coactivates the glucocorticoid receptor (GR) and the arginine rich N-terminus interacts with splicing factors and RNA. RNA-seq of neuronal cells ±siARGLU1found significant changes in the expression and alternative splicing of distinct genes involved in neurogenesis. Loss of ARGLU1 was embryonic lethal in mice, and knockdown in zebrafish caused neurodevelopmental and heart defects. Treatment with dexamethasone, a GR activator, also induced changes in the pattern of alternatively spliced genes, highlighting an underappreciated global mechanism of glucocorticoid action in neuronal cells. Thus, in addition to its basal role, ARGLU1 links glucocorticoid-mediated transcription and alternative splicing in neural cells, providing new avenues from which to investigate the molecular underpinnings of cognitive stress disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetRNA Research and Splicing→Travaux en français237 207→