The IRE1/bZIP60 Pathway and Bax Inhibitor 1 Suppress Systemic Accumulation of Potyviruses and Potexviruses in <i>Arabidopsis</i> and <i>Nicotiana benthamiana</i> Plants
Notice bibliographique
Résumé
The inositol requiring enzyme (IRE1) is an endoplasmic reticulum (ER) stress sensor. When activated, it splices the bZIP60 mRNA, producing a truncated transcription factor that upregulates genes involved in the unfolded protein response. Bax inhibitor 1 (BI-1) is another ER stress sensor that regulates cell death in response to environmental assaults. The potyvirus 6K2 and potexvirus TGB3 proteins are known to reside in the ER, serving, respectively, as anchors for the viral replicase and movement protein complex. This study used green fluorescent protein (GFP)-tagged Turnip mosaic virus (TuMV), Plantago asiatica mosaic virus (PlAMV), Potato virus Y (PVY), and Potato virus X (PVX) to determine that the IRE1/bZIP60 pathway and BI-1 machinery are induced early in virus infection in Arabidopsis thaliana, Nicotiana benthamiana, and Solanum tuberosum. Agrodelivery of only the potyvirus 6K2 or TGB3 genes into plant cells activated bZIP60 and BI-1 expression in Arabidopsis thaliana, N. benthamiana, and S. tuberosum. Homozygous ire1a-2, ire1b-4, and ire1a-2/ire1b-4 mutant Arabidopsis plants were inoculated with TuMV-GFP or PlAMV-GFP. PlAMV accumulates to a higher level in ire1a-2 or ire1a-2/ire1b-4 mutant plants than in ire1b-4 or wild-type plants. TuMV-GFP accumulates to a higher level in ire1a-2, ire1b-4, or ire1a-2/ire1b-4 compared with wild-type plants, suggesting that both isoforms contribute to TuMV-GFP infection. Gene silencing was used to knock down bZIP60 and BI-1 expression in N. benthamiana. PVX-GFP and PVY-GFP accumulation was significantly elevated in these silenced plants compared with control plants. This study demonstrates that two ER stress pathways, namely IRE1/bZIP60 and the BI-1 pathway, limit systemic accumulation of potyvirus and potexvirus infection. Silencing BI-1 expression also resulted in systemic necrosis. These data suggest that ER stress-activated pathways, led by IRE1 and BI-1, respond to invading potyvirus and potexviruses to restrict virus infection and enable physiological changes enabling plants to tolerate virus assault.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».