Characterizing the Size and Composition of Saposin A Lipoprotein Picodiscs
Notice bibliographique
Résumé
Saposin A (SapA) lipoprotein discs, also known as picodiscs (PDs), represent an attractive method to solubilize glycolipids for protein interaction studies in aqueous solution. Recent electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS) data suggest that the size and composition of 1-palmitoyl-2-oleoyl- sn -glycero-3-phosphocholine (POPC)-containing PDs at neutral pH differs from those of N, N -dimethyldodecylamine N -oxide determined by X-ray crystallography. Using high-resolution ESI-MS, multiangle laser light scattering (MALLS), and molecular dynamics (MD) simulations, the composition, heterogeneity, and structure of POPC–PDs in aqueous ammonium acetate solutions at pH 4.8 and 6.8 were investigated. The ESI-MS and MALLS data revealed that POPC–PDs consist predominantly of (SapA dimer + i POPC) complexes, with i = 23–29, and have an average molecular weight (MW) of 38.2 ± 3.3 kDa at pH 4.8. In contrast, in freshly prepared solutions at pH 6.8, POPC–PDs are composed predominantly of (SapA tetramer + i POPC) complexes, with i = 37–60, with an average MW of 68.0 ± 2.7 kDa. However, the (SapA tetramer + i POPC) complexes are unstable at neutral pH and convert, over a period of hours, to (SapA trimer + i POPC) complexes, with i = 29–36, with an average MW of 51.1 ± 2.9 kDa. The results of molecular modeling suggest spheroidal structures for the (SapA dimer + i POPC), (SapA trimer + i POPC), and (SapA tetramer + i POPC) complexes in solution. Comparison of measured collision cross sections (Ω) with values calculated for gaseous (SapA dimer + 26POPC) 8+, (SapA trimer + 33POPC) 12+, and (SapA tetramer + 42POPC) 16+ ions produced from modeling suggests that the solution structures are largely preserved in the gas phase, although the lipids do not maintain regular bilayer orientations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».