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Enregistrement W2516903124 · doi:10.1182/blood.v112.11.3340.3340

Epigenetic Regulation of the WNT Canonical Pathway in Mantle Cell Lymphoma.

2008· article· en· W2516903124 sur OpenAlexaff
Anthea Peters, Randy Chung, Charles S. Wong, Leah C. Young, Tony Reiman, Raymond Lai

Notice bibliographique

RevueBlood · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWnt signaling pathwayDemethylating agentLRP5DNA methylationCancer researchEpigeneticsBiologyMantle cell lymphomaLRP6GSK-3Signal transductionCell biologyGene expressionLymphomaImmunologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Dysregulation of the WNT signalling pathway is an important event in the pathogenesis of several types of cancer, including colon cancer and acute leukemia. When a WNT protein binds to its receptor, glycogen synthase kinase (GSK)-3β is inactivated by phosphorylation (i.e. pGSK-3β) allowing β-catenin to accumulate in the nucleus and promote transcription of proliferative genes. Conversely, a protein complex that includes GSK-3β initiates destruction of β-catenin if no WNT protein binds its receptor or if an antagonist interferes with WNT ligand-receptor interaction. We previously demonstrated that the WNT canonical pathway is often constitutively active in mantle cell lymphoma (MCL), a subtype of B-cell non-Hodgkin lymphoma. We showed that GSK-3β is phosphorylated, thus inactive, in two-thirds of MCL cases, and that a high level of pGSK-3β correlates with both β-catenin expression and poor patient survival. In order to elucidate the mechanisms of constitutive WNT signalling in MCL, we investigated the RNA expression of six WNT pathway antagonists including WIF-1 using fresh tumour samples and three types of cultured MCL cells. In vivo WIF-1 expression was abundant only in tumours shown to lack pGSK-3β expression. We also examined the regulation of these WNT antagonists by promoter methylation by treating cultured cells with demethylating agent 5-aza-2’-deoxycytidine. The WNT pathway inhibitors were often negatively regulated in MCL-derived cell lines by epigenetic DNA methylation; inhibitors that were not expressed at baseline showed expression after demethylation treatment in at least one MCL cell line. Methylation-specific PCR confirmed that the promoter region of WIF-1 was methylated in almost half of MCL tumour samples. Our data demonstrates that in MCL several antagonists of the canonical WNT pathway are negatively regulated by promoter methylation, thereby allowing aberrant WNT pathway activation. This data confirms that WNT signalling is important in MCL pathogenesis, and identifies potential therapeutic targets for MCL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,210
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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