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Enregistrement W2517267542 · doi:10.2450/2016.0034-16

Functional characterisation of the type 1 von Willebrand disease candidate VWF gene variants: p.M771I, p.L881R and p.P1413L.

2017· article· en· W2517267542 sur OpenAlexaff
Ergül Berber, Mehmet Özbil, Christine Brown, Zafer Başlar, S. Hande Çağlayan, David Lillicrap

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePlatelet Disorders and Treatments
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVon Willebrand factorVon Willebrand diseaseMissense mutationMolecular biologyIntracellularRecombinant DNAChemistryWild typeMutantMutationBiologyImmunologyGeneCell biologyBiochemistryPlatelet

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Abnormalities in the biosynthetic pathway or increased clearance of plasma von Willebrand factor (VWF) are likely to contribute to decreased plasma VWF levels in inherited type 1 von Willebrand disease (VWD). Recent studies demonstrated that 65% of type 1 VWD patients have candidate VWF mutations, the majority of which are missense variants. The purpose of this study was to explore the effects of three VWF missense mutations (p.M771I, p.L881R and p.P1413L) located in different functional domains of VWF, reported as candidate mutations in type 1 VWD patients in the course of the MCMDM-1VWD study. MATERIALS AND METHODS: The focus of these studies was on the intracellular biosynthetic processing and localisation of VWF in a heterologous cell system. Molecular dynamic simulation for p.M771I and p.P1413L was also performed to analyse the conformational effects of the changes. RESULTS: As determined by immunofluorescence antibody staining and confocal microscopy of HEK293 cells, the intracellular localisation of recombinant VWF with the p.M771I variation was impaired. Transient transfection studies and phorbol myristate acetate stimulation in COS-7 cells revealed significant intracellular retention. In addition, major loss of VWF multimers was observed for only the p.M771I mutation. Molecular dynamic simulations on p.M771I mutant VWF revealed distinct structural rearrangements including a large deviation in the E' domain, and significant loss of β-sheet secondary structure. DISCUSSION: The pathogenic effects of candidate VWF gene mutations were explored in this study. In vitro expression studies in heterologous cell systems revealed impaired secretion of VWF and a dominant negative effect on the processing of the wild-type protein for only the p.M771I mutation and none of the mutations affected the regulated secretion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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