pH drop impacts differentially skin and gut microbiota of the Amazonian fish tambaqui (Colossoma macropomum)
Notice bibliographique
Résumé
Aquatic organisms are increasingly exposed to lowering of environmental pH due to anthropogenic pressure (e.g. acid rain, acid mine drainages). Such acute variations trigger imbalance of fish-associated microbiota, which in turn favour opportunistic diseases. We used the tambaqui (Colossoma macropomum), an Amazonian fish tolerant to significant pH variation in its natural environment, to assess the response of fish endogenous microbiota to acute short-term acid stress. We exposed 36 specimens of tambaquis to acidic water (pH 4.0) over 2 consecutive weeks and sampled cutaneous mucus, feces and water at 0, 7 &14 days. The 16S RNA hypervariable region V4 was sequenced on Illumina MiSeq. After two weeks of acidic exposure, fecal and skin microbiota taxonomic structures exhibited different patterns: skin microbiota was still exhibiting a significantly disturbed composition whereas fecal microbiota recovered a similar composition to control group, thus suggesting a stronger resilience capacity of the intestinal microbiota than cutaneous microbiota.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».