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Enregistrement W2517487300 · doi:10.1093/toxsci/kfw163

Dose-Dependent Metabolic Reprogramming and Differential Gene Expression in TCDD-Elicited Hepatic Fibrosis

2016· article· en· W2517487300 sur OpenAlexfundno aff
Rance Nault, Kelly A. Fader, Dustin A. Ammendolia, Peter Dornbos, Dave Potter, Bonnie Sharratt, Kazuyoshi Kumagai, Jack R. Harkema, Sophia Y. Lunt, Jason Matthews, Tim Zacharewski

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Disease Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesIncyteNational Institutes of HealthNational Institute of Environmental Health SciencesCanadian Institutes of Health ResearchUniversitetet i OsloU.S. Department of Defense
Mots-clésAscorbic acidEndocrinologyInternal medicineFibrosisGlycogenProinflammatory cytokineBiologyChemistryInflammationMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously shown that in response to 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD)-elicited NAFLD progression, central carbon, glutaminolysis, and serine/folate metabolism are reprogrammed to support NADPH production and ROS defenses. To further investigate underlying dose-dependent responses associated with TCDD-induced fibrosis, female C57BL/6 mice were gavaged with TCDD every 4 days (d) for 28 d or 92 d. RNA-Seq, ChIP-Seq (2 h), and 28 d metabolomic (urine, serum, and hepatic extract) analyses were conducted with complementary serum marker assessments at 92 d. Additional vehicle and 30 µg/kg treatment groups were allowed to recover for 36 d following the 92-d treatment regimen to examine recovery from TCDD-elicited fibrosis. Histopathology revealed dose-dependent increases in hepatic fat accumulation, inflammation, and periportal collagen deposition at 92 days, with increased fibrotic severity in the recovery group. Serum proinflammatory and profibrotic interleukins-1β, -2, -4, -6, and -10, as well as TNF-α and IFN-γ, exhibited dose-dependent induction. An increase in glucose tolerance was observed with a concomitant 3.0-fold decrease in hepatic glycogen linked to increased ascorbic acid biosynthesis and proline metabolism, consistent with increased fibrosis. RNA-Seq identified differential expression of numerous matrisome genes including an 8.8-fold increase in Tgfb2 indicating myofibroblast activation. Further analysis suggests reprogramming of glycogen, ascorbic acid, and amino acid metabolism in support of collagen deposition and the use of proline as a substrate for ATP production via the proline cycle. In summary, we demonstrate that glycogen, ascorbic acid, and amino acid metabolism are also reorganized to support remodeling of the extracellular matrix, progressing to hepatic fibrosis in response to chronic injury from TCDD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,253
Score d'incertitude au seuil0,457

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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