MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2517785578 · doi:10.18632/oncotarget.11408

Identification of breast cancer cell subtypes sensitive to ATG4B inhibition

2016· article· en· W2517785578 sur OpenAlex
Svetlana Bortnik, Courtney Choutka, Hugo M. Horlings, Samuel Leung, Jennifer H.E. Baker, Chandra B Lebovitz, Wieslawa H. Dragowska, Nancy E. Go, Marcel B. Bally, Andrew I. Minchinton, Karen A. Gelmon, Sharon M. Gorski

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueOncotarget · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensVancouver General HospitalSimon Fraser UniversityCentre for Drug Research and DevelopmentBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBreast cancerCancerAgency (philosophy)Library scienceGerontologyInternal medicineSociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

// Svetlana Bortnik 1, 2 , Courtney Choutka 1, 3 , Hugo M. Horlings 4, 5, 6 , Samuel Leung 4, 5 , Jennifer H. Baker 7 , Chandra Lebovitz 1, 3 , Wieslawa H. Dragowska 8 , Nancy E. Go 1 , Marcel B. Bally 8, 9, 10, 11 , Andrew I. Minchinton 7 , Karen A. Gelmon 12, 13 , Sharon M. Gorski 1, 2, 3, 14 1 The Genome Sciences Centre, BC Cancer Agency, Vancouver, BC, Canada 2 Interdisciplinary Oncology Program, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada 3 Department of Molecular Biology and Biochemistry, Simon Fraser University, Burnaby, BC, Canada 4 Department of Pathology and Laboratory Medicine, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada 5 Vancouver General Hospital, BC Cancer Agency, Vancouver, BC, Canada 6 Department of Pathology, Netherlands Cancer Institute, Amsterdam, The Netherlands 7 Radiation Biology Unit - Department of Integrative Oncology, BC Cancer Agency, Vancouver, BC, Canada 8 Department of Experimental Therapeutics, BC Cancer Agency, Vancouver, BC, Canada 9 Faculty of Pharmaceutical Sciences, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada 10 Department of Pathology and Laboratory Medicine, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada 11 Centre for Drug Research and Development, Vancouver, BC, Canada 12 Medical Oncology, BC Cancer Agency, Vancouver, BC, Canada 13 Department of Medicine, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada 14 Centre for Cell Biology, Development, and Disease, Simon Fraser University, Burnaby, BC, Canada Correspondence to: Svetlana Bortnik, email: sbortnik@bcgsc.ca Keywords: breast cancer, autophagy, ATG4B, HER2, trastuzumab Received: March 20, 2016     Accepted: August 09, 2016     Published: August 19, 2016 ABSTRACT Autophagy, a lysosome-mediated degradation and recycling process, functions in advanced malignancies to promote cancer cell survival and contribute to cancer progression and drug resistance. While various autophagy inhibition strategies are under investigation for cancer treatment, corresponding patient selection criteria for these autophagy inhibitors need to be developed. Due to its central roles in the autophagy process, the cysteine protease ATG4B is one of the autophagy proteins being pursued as a potential therapeutic target. In this study, we investigated the expression of ATG4B in breast cancer, a heterogeneous disease comprised of several molecular subtypes. We examined a panel of breast cancer cell lines, xenograft tumors, and breast cancer patient specimens for the protein expression of ATG4B, and found a positive association between HER2 and ATG4B protein expression. We showed that HER2-positive cells, but not HER2-negative breast cancer cells, require ATG4B to survive under stress. In HER2-positive cells, cytoprotective autophagy was dependent on ATG4B under both starvation and HER2 inhibition conditions. Combined knockdown of ATG4B and HER2 by siRNA resulted in a significant decrease in cell viability, and the combination of ATG4B knockdown with trastuzumab resulted in a greater reduction in cell viability compared to trastuzumab treatment alone, in both trastuzumab-sensitive and -resistant HER2 overexpressing breast cancer cells. Together these results demonstrate a novel association of ATG4B positive expression with HER2 positive breast cancers and indicate that this subtype is suitable for emerging ATG4B inhibition strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,237

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle