Single-cell transcriptome and epigenomic reprogramming of cardiomyocyte-derived cardiac progenitor cells
Notice bibliographique
Résumé
The molecular basis underlying the dedifferentiation of mammalian adult cardiomyocytes (ACMs) into myocyte-derived cardiac progenitor cells (mCPCs) during cardiac tissue regeneration is poorly understood. We present data integrating single-cell transcriptome and whole-genome DNA methylome analyses of mouse mCPCs to understand the epigenomic reprogramming governing their intrinsic cellular plasticity. Compared to parental cardiomyocytes, mCPCs display epigenomic reprogramming with many differentially-methylated regions, both hypermethylated and hypomethylated, across the entire genome. Correlating well with the methylome, our single-cell transcriptomic data show that the genes encoding cardiac structure and function proteins are remarkably down-regulated in mCPCs, while those for cell cycle, proliferation, and stemness are significantly up-regulated. In addition, implanting mCPCs into infarcted mouse myocardium improves cardiac function with augmented left ventricular ejection fraction. This dataset suggests that the cellular plasticity of mammalian cardiomyocytes is the result of a well-orchestrated epigenomic reprogramming and a subsequent global transcriptomic alteration. Understanding cardiomyocyte epigenomic reprogramming may enable the design of future clinical therapies that induce cardiac regeneration, and prevent heart failure.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».