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Enregistrement W2519023280 · doi:10.1016/j.ympev.2016.09.009

Hidden diversity within the lizard genus Liolaemus: Genetic vs morphological divergence in the L. rothi complex (Squamata:Liolaeminae)

2016· review· en· W2519023280 sur OpenAlexfundno aff
Melisa Olave, Luciano Javier Ávila, Jack W. Sites, Mariana Morando

Notice bibliographique

RevueMolecular Phylogenetics and Evolution · 2016
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOffice of International Science and EngineeringUniversidad Austral de ChileUniversidad de ConcepciónAgencia Nacional de Promoción Científica y TecnológicaConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y TécnicasFondo para la Investigación Científica y TecnológicaDalhousie UniversityBrigham Young UniversityUniversidad Nacional de CórdobaNational Science Foundation
Mots-clésBiologySquamataLizardDivergence (linguistics)GenusZoologyEvolutionary biologyGenetic divergenceGenetic diversityEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Currently, Liolaemus is the second most species-rich reptile genus in the world (257 species), and predictions of its real diversity suggest that it may be the most diverse genus. Originally, Liolaemus species were described as widely distributed and morphologically variable taxa, but extensive sampling in previously unexplored geographic areas, coupled with molecular and more extensive morphological studies, have discovered an unexpectedly high number of previously undetected species. Here, we study the level of molecular vs. morphological divergence within the L. rothi complex, combining a total of 14 loci (2 mitochondrial and 12 nuclear loci) for 97 individuals, as well as morphological data (nine morphometric and 15 color pattern variables), that represent all six described species of the L. rothi complex, plus two candidate species. We use the multi-coalescent species delimitation program iBPP and resolve strong differences in molecular divergence; and each species is inferred as an independent lineage supported by high posterior probabilities. However, morphological differences are not that clear, and our modeling of morphological characters suggests differential selection pressures implying some level of morphological stasis. We discuss the role of natural selection on phenotypic traits, which may be an important factor in "hiding" the real diversity of the genus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,898
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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