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Enregistrement W2519176635

Regulation of STING expression via the RIG-I dependent RNA sensing pathway

2014· article· en· W2519176635 sur OpenAlexaff
Rongtuan Lin Yiliu Liu Sidi Mehdi Belgnaoui Alex, er Sze MarieLine Goulet, Chunfu Zheng

Notice bibliographique

RevueJournal of Vaccines & Vaccination · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStingIRF3RIG-IBiologyCell biologySignal transducing adaptor proteinRNAStimulator of interferon genesSignal transductionInnate immune systemReceptorGeneGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

T cytoplasmic pattern recognition receptor RIG-I is essential for recognizing RNA viruses with a 5’ triphosphate (ppp) signature. Upon viral RNA recognition, RIG-I recruits adaptor protein MAVS to trigger the activation of IRF3 and NFkB transcription factors through TBK1-IKK complexes, leading to the production of type I IFNs (α, β), pro-inflammatory cytokines, and antiviral factors. STING has been identified as an RIG-I signaling cofactor and a critical adaptor protein in a recently identified cGAS-mediated cytosolic DNA sensing pathway. In a recent functional study aiming to gain system-wide insight into downstream effector function of RIG-I, we identified STING among a plethora of differentially expressed genes induced by the RIG-I agonist 5’ppp RNA; in the present study, we further detail the mechanism of STING regulation. Our data shows that Sendai virus (SeV) infection induces STING expression at both the mRNA and protein levels in various cell types including A549, Huh7, PC3, and U87. Furthermore, by employing multiple RIG-I deficient or pathway-impaired cell lines, STING induction is shown to be dependent on functional RIG-I signaling. STING induction by the RIG-I agonist 5’ppp RNA was recognized as a delayed event resulting from an autocrine/paracrine mechanism. Indeed, co-treatment with TNFα and IFNα has a synergistic effect on the regulation of STING expression. Following SeV infection or TNFα-IFNα combined treatment, STING induction is partially decreased by siRelA or siIRF3; and is strongly diminished under combined siRelA and siIRF3 condition. Taken together, these observations demonstrate that STING expression is regulated via RIG-I signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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Résumé présentoui

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