Regulation of STING expression via the RIG-I dependent RNA sensing pathway
Notice bibliographique
Résumé
T cytoplasmic pattern recognition receptor RIG-I is essential for recognizing RNA viruses with a 5’ triphosphate (ppp) signature. Upon viral RNA recognition, RIG-I recruits adaptor protein MAVS to trigger the activation of IRF3 and NFkB transcription factors through TBK1-IKK complexes, leading to the production of type I IFNs (α, β), pro-inflammatory cytokines, and antiviral factors. STING has been identified as an RIG-I signaling cofactor and a critical adaptor protein in a recently identified cGAS-mediated cytosolic DNA sensing pathway. In a recent functional study aiming to gain system-wide insight into downstream effector function of RIG-I, we identified STING among a plethora of differentially expressed genes induced by the RIG-I agonist 5’ppp RNA; in the present study, we further detail the mechanism of STING regulation. Our data shows that Sendai virus (SeV) infection induces STING expression at both the mRNA and protein levels in various cell types including A549, Huh7, PC3, and U87. Furthermore, by employing multiple RIG-I deficient or pathway-impaired cell lines, STING induction is shown to be dependent on functional RIG-I signaling. STING induction by the RIG-I agonist 5’ppp RNA was recognized as a delayed event resulting from an autocrine/paracrine mechanism. Indeed, co-treatment with TNFα and IFNα has a synergistic effect on the regulation of STING expression. Following SeV infection or TNFα-IFNα combined treatment, STING induction is partially decreased by siRelA or siIRF3; and is strongly diminished under combined siRelA and siIRF3 condition. Taken together, these observations demonstrate that STING expression is regulated via RIG-I signaling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».