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Enregistrement W2519202495 · doi:10.1158/1557-3125.modorg-a33

Abstract A33: Towards validation of three-dimensional nuclear telomeric profiles as a biomarker of myelodysplastic syndromes and acute myeloid leukemias in a mouse model

2014· article· en· W2519202495 sur OpenAlexaff
Macoura Gadji, Prerana Rodrigues, Sabine Mai

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensUniversity of WinnipegCancerCare ManitobaCanola Council of CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMyelodysplastic syndromesTelomereCytopeniaMyeloid leukemiaBone marrowDysplasiaBiologyMyeloidDyskeratosis congenitaBiomarkerCancer researchMedicinePathologyImmunologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: Myelodysplastic Syndromes (MDS) are a group of disorders characterized by cytopenias, with a propensity for evolution into Acute Myeloid Leukemias (AML). However, the cellular and molecular mechanisms causing the transition of MDS to AML remain unknown. Method: Following our published data in human MDS and AML samples1, we are studying the three-dimensional nuclear telomeric profiles based on telomere numbers, telomeric aggregates, telomere signal intensities, nuclear volumes, and nuclear telomere distribution in a unique mouse model that shows progression from MDS to AML “C57BL/6-Tg(Vava1-NUP98/HOXD13)G2Apla/J”2. These hemizygote mice develop MDS with peripheral blood cytopenia and dysplasia and normocellular to hypercellular bone marrow. By 14 months of age, a subset of hemizygotes succumbs to malignant AML or severe anemia and leucopenia. In the last few months, we set up a colony of these mice at MICB/CCMB. The transgenic mice have been bred with C57BL/6NCrL mice. All mice were genotyped and the wild-type littermates are being used as controls. Results: We have started to sample the mice for this study. In total, we are observing 75 C57BL/6-Tg(Vava1-NUP98/HOXD13)G2Apla/J and 75 C57BL/6NCrL mice. The extra 20 mice (10 C57BL/6-Tg(Vava1-NUP98/HOXD13)G2Apla/J mice and 10 C57BL/6NCrL) will be used as a back – up for replacement of the sudden death of mice over the time of this project. The time points of harvesting are at 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 and 14 months. We already harvested 21 transgenic mice prematurely (outside this harvesting scheme) due to signs of illness at different ages. All these 21 mice developed MDS and just transformed to AML confirmed by cytological analyzes of the mouse bone marrow showed increasing numbers of blast cells characteristic to AML status. Their 3D telomere profiles were done comparatively to sex and age matched-control ones. We found a trend of chronological telomere dysfunction in mice that is similar to the human condition. Finally, the two-telomere pathways of progression from MDS to AML already defined with human samples appear to be confirmed by the mouse samples. Conclusion(s): This mutant mouse strain is useful to examine our 3D nuclear telomeric profiling of both diseases. Since transgenic mice/non transgenic littermate mice share the same genetic background, except the transgene, the 3D profiles and any genetic abnormalities found will be a resultant of the disease initiation and/or progression Outcome / Impact: We will gain a better understanding of the nuclear processes leading to this transition between MDS and AML that will provide a new basis for new molecular therapeutic strategies aimed at improving the dire prognosis of MDS, AML/MDS and AML. This will, in the future, aid in individualized (personalized) patient management. References: 1. Gadji M, Adebayo Awe J, Rodrigues P, et al. Profiling three-dimensional nuclear telomeric architecture of myelodysplastic syndromes and acute myeloid leukemia defines patient subgroups. Clin Cancer Res. 2012;18:3293-3304. 2. Lin YW, Slape C, Zhang Z, Aplan PD. NUP98-HOXD13 transgenic mice develop a highly penetrant, severe myelodysplastic syndrome that progresses to acute leukemia. Blood. 2005;106:287-295. Citation Format: Macoura Gadji, Prerana Rodrigues, Sabine Mai. Towards validation of three-dimensional nuclear telomeric profiles as a biomarker of myelodysplastic syndromes and acute myeloid leukemias in a mouse model. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: The Translational Impact of Model Organisms in Cancer; Nov 5-8, 2013; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Res 2014;12(11 Suppl):Abstract nr A33.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,147
Score d'incertitude au seuil0,757

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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