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Enregistrement W2519443022

Genetic Dissection of Neuromuscular Diseases Affecting Domestic Dogs

2014· article· en· W2519443022 sur OpenAlexaboutno aff
Caitlin J. Rinz

Notice bibliographique

RevueTigerPrints (Clemson University) · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurological diseases and metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAmerican Kennel Club Canine Health Foundation
Mots-clésDissection (medical)MedicinePhysical medicine and rehabilitationAnatomy
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The domestic dog, Canis familiaris, has a unique population structure that lends itself to the study of hereditary diseases. Purebred dogs populations are genetically isolated and as a result are affected by more than 400 naturally occurring diseases, many of which have human counterparts. In the last 15 years, dogs have emerged as a model for the study of human hereditary diseases, fueling the development of resources including a 7.6X coverage reference genome and single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping arrays.\nCongenital myasthenic syndrome (CMS) is a neuromuscular disorder of both humans and dogs in which transmission across the neuromuscular junction is compromised. Affected individuals exhibit generalized muscle weakness that is exacerbated with exercise. To date, 18 genes are known to harbor mutations causative for CMS in humans. We characterized a novel CMS in a family of Labrador Retrievers. Using whole genome SNP profiles we identified COLQ as a candidate gene. In the neuromuscular junction, ColQ acts as an anchor for acetylcholinesterase, which is responsible for terminating the signal for muscle contraction. Sequencing revealed a missense mutation in exon 14 that predicts the substitution of a threonine for an isoleucine at a conserved position.\nThe Jack Russell Terrier (JRT) is the first dog breed in which CMS was reported in the 1970s. Immunohistochemistry revealed an acetylcholine receptor (AChR) deficiency in affected dogs. Analysis of microsatellites flanking the five AChR subunit genes indicated that haplotypes encompassing CHRNB1 and CHRNE are consistent with inheritance identical by descent. Sequencing revealed a frameshift mutation in exon 7 of CHRNE (G193RfsX272) that is homozygous in recent CMS cases, as well as those from the 1970s.\nCongenital idiopathic megaesophagus (ME) is another neuromuscular condition observed in both humans and dogs characterized by an enlarged esophagus. Affected dogs are unable to move food into their stomachs, resulting in regurgitation and frequent aspiration pneumonia. ME is prevalent among German Shepherd Dogs (GSDs). We employed a genome-wide association study to identify genomic regions harboring genes underlying ME. Using 19 affected and 177 unaffected GSDs, we identified an associated region on chromosome 12.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,901
Score d'incertitude au seuil0,607

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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Résumé présentoui

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