MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2519670684 · doi:10.1021/acscentsci.6b00086

Open Source Drug Discovery: Highly Potent Antimalarial Compounds Derived from the Tres Cantos Arylpyrroles

2016· article· en· W2519670684 sur OpenAlexaff
Alice Williamson, Paul M. Ylioja, Murray N. Robertson, Yevgeniya Antonova‐Koch, Vicky M. Avery, Jonathan B. Baell, Harikrishna Batchu, Sanjay Batra, Jeremy N. Burrows, Soumya Bhattacharyya, Félix Calderón, Susan A. Charman, Julie Clark, Benigno Crespo, Matin Dean, Stefan L. Debbert, Michael J. Delves, Adelaide S. M. Dennis, Frederik Deroose, Sandra Duffy, Sabine Fletcher, Guri Giaever, Irene Hallyburton, Francisco‐Javier Gamo, Marinella Gebbia, R. Kiplin Guy, Zoë Hungerford, Kiaran Kirk, María José Lafuente-Monasterio, Anna Lee, Stephan Meister, Corey Nislow, John P. Overington, George Papadatos, Luc Patiny, James S. Pham, Stuart A. Ralph, Andrea Ruecker, Eileen Ryan, Christopher Southan, Kumkum Srivastava, Chris Swain, Matthew J. Tarnowski, Patrick Thomson, Peter Turner, Iain M. Wallace, Timothy N. C. Wells, Karen L. White, Laura M. White, Paul Willis, Elizabeth A. Winzeler, Sergio Wittlin, Matthew H. Todd

Notice bibliographique

RevueACS Central Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesDivision of ChemistryMedicines for Malaria VentureUniversiteit MaastrichtNational Health and Medical Research CouncilUniversity of EdinburghUniversity of SouthamptonMedical Research CouncilNational Science FoundationWellcomeEuropean Molecular Biology LaboratoryAustralian Research CouncilWellcome Trust
Mots-clésDrug discoveryMalariaGametocytePhenotypic screeningComputational biologyOpen sourceDrugPotencyDrug developmentCombinatorial chemistryComputer scienceBiologyChemistryPharmacologyData scienceBiochemistryIn vitroPlasmodium falciparumPhenotypeSoftwareImmunologyProgramming language

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The development of new antimalarial compounds remains a pivotal part of the strategy for malaria elimination. Recent large-scale phenotypic screens have provided a wealth of potential starting points for hit-to-lead campaigns. One such public set is explored, employing an open source research mechanism in which all data and ideas were shared in real time, anyone was able to participate, and patents were not sought. One chemical subseries was found to exhibit oral activity but contained a labile ester that could not be replaced without loss of activity, and the original hit exhibited remarkable sensitivity to minor structural change. A second subseries displayed high potency, including activity within gametocyte and liver stage assays, but at the cost of low solubility. As an open source research project, unexplored avenues are clearly identified and may be explored further by the community; new findings may be cumulatively added to the present work.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations105
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueACS Central ScienceMême sujetMalaria Research and ControlTravaux en français237 207