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Enregistrement W2520560839 · doi:10.1373/jalm.2016.020537

Inter-Laboratory Robustness of Next-Generation Bile Acid Study in Mice and Humans: International Ring Trial Involving 12 Laboratories

2016· article· en· W2520560839 sur OpenAlexaff
Hai Thanh Pham, Kathrin Arnhard, Yasmin J. Asad, Lu Deng, Thomas K. Felder, Lisa St. John‐Williams, Volkhard Kaever, Michael Leadley, Nico Mitro, Stephané Muccio, Cornelia Prehn, Manfred Rauh, Ulrike Rolle‐Kampczyk, Paul M. Thompson, Olaf Uhl, Marynka Ulaszewska, Michael Vogeser, David S. Wishart, Therese Koal

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Applied Laboratory Medicine · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBile acidRobustness (evolution)StandardizationMedicineComputer scienceChemistryInternal medicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The increasing relevance of individual bile acids quantification in biological samples requires analytical standardization to guarantee robustness and reliability of laboratory results. We have organized the first international ring trial, carried out in 12 laboratories, to evaluate the newly developed LC-MS/MS-based test kit for bile acid analysis. METHODS: Each laboratory received a Biocrates® Bile Acids Kit including system suitability test (SST) protocol. The kit is designed to analyze 16 individual human and 19 mouse bile acids. A set of 9 human and mouse plasma samples was measured in replicates. Laboratories were first required to pass the acceptance criteria for the SST. Within the subset of laboratories passing SST criteria, we evaluated how many laboratories met the target criteria of 80% of reported values with a relative accuracy within the 70%-130% range and analytical precisions (%CV) below 30%. RESULTS: A total of 12 of 16 participating laboratories passed the SST as the prerequisite to enter the ring trial. All 12 laboratories were then able to successfully run the kit and ring trial samples. Of the overall reported values, 94% were within 70%-130% relative accuracy range. Mean precision was 8.3% CV. The condition of CV <30% was fulfilled by 99% of the reported values. CONCLUSIONS: The first publically available interlaboratory ring trial for standardized bile acids quantification in human and mouse plasma samples showed very good analytical performance, within acceptance criteria typically applied in the preclinical environment. The kit is therefore suitable for standardized quantitative bile acid analysis and the establishment of reference values.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,083
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,039
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,917
Score d'incertitude au seuil0,441

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0830,039
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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