OS 05-01 PROX1 GENE CC GENOTYPE AS A MAJOR DETERMINANT OF EARLY ONSET OF T2D AND CARDIOVASCULAR COMPLICATIONS IN SLAVIC SUBJECTS FROM ADVANCE STUDY
Notice bibliographique
Résumé
Objective: We have previously reported distinct genetic architectures of renal impairment in T2D patients of Slavic and Celtic origins participating in the ADVANCE trial (J Hypertens. 2015 Jun;33 Suppl 1:e3). Further analysis suggests that the major driver of the difference in the prevalence of T2D complications between Slavic and Celtic groups is due to an earlier onset of diabetes in Slavic patients. In an attempt to distinguish between environmental and genetic factors on age of onset of diabetes, we have determined the age of onset of T2D in Slavic subjects living in Celtic countries and confirmed the same earlier onset (-2 years) in these subjects, notwithstanding their living environment. Design and Method: We performed GWAS analyses of age of onset of T2D in 3500 T2D patients from ADVANCE trial. Analyses were done for Celtic and Slavic groups separately and combined. Results: 7 loci are associated to age of onset of T2D in patients of both Celtic and Slavic origins, including HDAC9 gene (rs1128745). 9 loci are selectively associated to this phenotype in patients of Celtic origin, including the Il23R (rs1273974) while 9 different loci are associated to it in Slavic patients only. Among the latter, PROX1/PROX1-AS1 genes (rs340841) has the highest effect size. SNP rs 340841 homozygous CC genotype is associated with 2 years earlier onset of T2D in Slavic patients living in Slavic countries or in Celtic countries. This locus is also associated with eGFR decline in Slavic, with macroalbuminuria and hypertension in all ADVANCE subjects of Caucasian origin and with Interleukin-6 levels at baseline. In recent literature search we found that PROX1 gene has been associated with abnormalities of glucose metabolism and risk of diabetes with variations depending on ethnicity. Conclusions: We conclude that fine granularity of distinction in geo-ethic background assist in resolution of clinically relevant genetic contribution to cardiovascular complication in T2D.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».