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Enregistrement W2521500918 · doi:10.1093/neuonc/now156

Spinal column chordoma: prognostic significance of clinical variables and<i>T (brachyury</i>) gene SNP rs2305089 for local recurrence and overall survival

2016· article· en· W2521500918 sur OpenAlexaff
Chetan Bettegowda, Stephen Yip, Sheng-Fu Larry Lo, Charles G. Fisher, Stefano Boriani, Laurence D. Rhines, Joanna Y. Wang, Áron Lazáry, Marco Gambarotti, Wei‐Lien Wang, Alessandro Luzzati, Mark B. Dekutoski, Mark H. Bilsky, Dean Chou, Michael G. Fehlings, Edward F. McCarthy, Nasir A. Quraishi, Jeremy Reynolds, Daniel M. Sciubba, Richard P. Williams, Jean‐Paul Wolinsky, Patricia L. Zadnik, Ming Zhang, Niccole Germscheid, Vasiliki Kalampoki, Péter Varga, Ziya L. Gokaslan

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone Tumor Diagnosis and Treatments
Établissements canadiensToronto Western HospitalUniversity of TorontoUniversity of British ColumbiaVancouver Coastal Health
Organismes subventionnairesAOSpineAO Foundation
Mots-clésBrachyuryMedicineHazard ratioSNPChordomaInternal medicineOncologySingle-nucleotide polymorphismOverall survivalGastroenterologyClinical significanceSurgeryConfidence intervalGenotypeBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Chordomas are rare, locally aggressive bony tumors associated with poor outcomes. Recently, the single nucleotide polymorphism (SNP) rs2305089 in the T (brachyury) gene was strongly associated with sporadic chordoma development, but its clinical utility is undetermined. Methods: In 333 patients with spinal chordomas, we identified prognostic factors for local recurrence-free survival (LRFS) and overall survival and assessed the prognostic significance of the rs2305089 SNP. Results: The median LRFS was 5.2 years from the time of surgery (95% CI: 3.8-6.0); greater tumor volume (≥100cm3) (hazard ratio [HR] = 1.99, 95% CI: 1.26-3.15, P = .003) and Enneking inappropriate resections (HR = 2.35, 95% CI: 1.37-4.03, P = .002) were independent predictors of LRFS. The median overall survival was 7.0 years (95% CI: 5.8-8.4), and was associated with older age at surgery (HR = 1.11 per 5-year increase, 95% CI: 1.02-1.21, P = .012) and previous surgical resection (HR = 1.73, 95% CI: 1.03-2.89, P = .038). One hundred two of 109 patients (93.6%) with available pathologic specimens harbored the A variant at rs2305089; these patients had significantly improved survival compared with those lacking the variant (P = .001), but there was no association between SNP status and LRFS (P = .876). Conclusions: The ability to achieve a wide en bloc resection at the time of the primary surgery is a critical preoperative consideration, as subtotal resections likely complicate later management. This is the first time the rs2305089 SNP has been implicated in the prognosis of individuals with chordoma, suggesting that screening all patients may be instructive for risk stratification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,251
Score d'incertitude au seuil0,615

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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