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Enregistrement W2521605537 · doi:10.1681/asn.2016020231

The Genetic Landscape of Renal Complications in Type 1 Diabetes

2016· article· en· W2521605537 sur OpenAlexaff
Niina Sandholm, Natalie Van Zuydam, Emma Ahlqvist, Thorhildur Juliusdottir, Harshal Deshmukh, Nigel W. Rayner, Barbara Di Camillo, Carol Forsblom, João Fadista, Daniel Ziemek, Rany M. Salem, Linda T. Hiraki, Marcus G. Pezzolesi, David‐Alexandre Trégouët, Emma H. Dahlström, Erkka Valo, Nikolay Oskolkov, Claes Ladenvall, M. Loredana Marcovecchio, Jason D. Cooper, Francesco Sambo, Alberto Malovini, Marco Manfrini, Amy Jayne McKnight, Maria Lajer, Valma Harjutsalo, Daniel Gordin, Maija Parkkonen, Valeriya Lyssenko, Paul McKeigue, Stephen S. Rich, M. Julia Brosnan, Eric B. Fauman, Riccardo Bellazzi, Peter Rossing, Samy Hadjadj, Andrzej S. Królewski, Andrew D. Paterson, Joel N. Hirschhorn, Alexander P. Maxwell, Claudio Cobelli, Helen M. Colhoun, Mark I. McCarthy, Per‐Henrik Groop

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensOntario GenomicsHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesAbbott Diabetes CareNational Institutes of HealthNovo Nordisk FondenEuropean Association for the Study of DiabetesSamfundet FolkhälsanMedical Research CouncilSigne ja Ane Gyllenbergin SäätiöPublic Health AgencyNovo NordiskNational Institute for Health and Care ResearchPfizerInsulet CorporationEuropean CommissionSteno Diabetes Center CopenhagenWellcome TrustAstellas PharmaRoche Diabetes CareWilhelm och Else Stockmanns StiftelseEli Lilly and CompanyFinska LäkaresällskapetNational Heart, Lung, and Blood InstituteHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriNiproScience Foundation IrelandGoddard Space Flight CenterFolkhälsanin TutkimussäätiöAstraZenecaMcKnight FoundationAmerican Diabetes AssociationNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesSanofi
Mots-clésMedicineType 2 diabetesDiabetes mellitusInternal medicineIntensive care medicineEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diabetes is the leading cause of ESRD. Despite evidence for a substantial heritability of diabetic kidney disease, efforts to identify genetic susceptibility variants have had limited success. We extended previous efforts in three dimensions, examining a more comprehensive set of genetic variants in larger numbers of subjects with type 1 diabetes characterized for a wider range of cross-sectional diabetic kidney disease phenotypes. In 2843 subjects, we estimated that the heritability of diabetic kidney disease was 35% ( P =6.4×10 −3 ). Genome-wide association analysis and replication in 12,540 individuals identified no single variants reaching stringent levels of significance and, despite excellent power, provided little independent confirmation of previously published associated variants. Whole-exome sequencing in 997 subjects failed to identify any large-effect coding alleles of lower frequency influencing the risk of diabetic kidney disease. However, sets of alleles increasing body mass index ( P =2.2×10 −5 ) and the risk of type 2 diabetes ( P= 6.1×10 −4 ) associated with the risk of diabetic kidney disease. We also found genome-wide genetic correlation between diabetic kidney disease and failure at smoking cessation ( P =1.1×10 −4 ). Pathway analysis implicated ascorbate and aldarate metabolism ( P =9.0×10 −6 ), and pentose and glucuronate interconversions ( P =3.0×10 −6 ) in pathogenesis of diabetic kidney disease. These data provide further evidence for the role of genetic factors influencing diabetic kidney disease in those with type 1 diabetes and highlight some key pathways that may be responsible. Altogether these results reveal important biology behind the major cause of kidney disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,658
Score d'incertitude au seuil0,252

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations134
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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