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Enregistrement W2521760569

Compensating for the meltdown: The critical effective size of a population with deleterious and compensatory mutations

2003· article· en· W2521760569 sur OpenAlexaff
Michael C. Whitlock, Cortland K. Griswold, A. D. Peters

Notice bibliographique

RevueAnnales Zoologici Fennici · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyExtinction (optical mineralogy)PopulationSmall population sizeGenetic driftFixation (population genetics)Population sizeEffective population sizeThreatened speciesEvolutionary biologyMutationMutation rateEcologyGeneticsGenetic variationHabitatDemographyGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the short term, the persistence of species depends on the continued existence of suitable habitat and protection from extraordinary causes of mortality, essentially ecological and socioeconomic problems. On a longer time-scale, however, genetic problems could become paramount. Populations that have only deleterious mutations eventually decline in fitness to extinction, because of the fixation by genetic drift of a small fraction of these mutations. This proceeds fastest in small populations, because genetic drift is a more powerful factor in these circumstances. If, as is biologically reasonable, some mutations are beneficial to the population, there will exist a critical effective size above which the population can persist indefinitely, because fixation of beneficial alleles can balance the effects of deleterious mutations. This critical effective size is likely to be in the hundreds, meaning a census population size in the thousands. If some mutations act to compensate for the detrimental effects of others, then the rate of beneficial mutations will increase as fitness declines; this causes the critical effective size to be even lower. In this paper, we review the theoretical impact of beneficial and compensatory mutations on the probability of extinction, as well as the substantial theoretical and empirical literature on compensation. There are many possible mechanisms for compensatory mutations. There are insufficient data to make quantitative predictions, but it is clear that there is more hope for preserving the genetic integrity of threatened species than previously thought.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0010,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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