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Enregistrement W2522447049 · doi:10.1021/acsmedchemlett.6b00300

Characterization of the Dynamic Equilibrium between Closed and Open Forms of the Benzoxaborole Pharmacophore

2016· article· en· W2522447049 sur OpenAlexafffund
Sergey Vshyvenko, Marissa L. Clapson, Itaru Suzuki, Dennis G. Hall

Notice bibliographique

RevueACS Medicinal Chemistry Letters · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAnalytical Chemistry and Chromatography
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Alberta
Mots-clésPharmacophoreComputer scienceChemistryStereochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Benzoxaboroles are a class of five-membered hemiboronic acids that recently attracted significant attention as a new pharmacophore on account of their unique structural and physicochemical properties and their ability to interact selectively with biomolecules. Their structural behavior in water and its effect on their physiological properties remain unclear, especially the question of dynamic hydrolytic equilibrium of the oxaborole ring. Herein, we used NMR spectroscopy, in mixed aqueous-organic solvent, to confirm the strong preference for the closed form of benzoxaborole and its six- and seven-membered homologues over the open boronic acid form. Only with the eight-membered homologue does the cyclic form become unfavorable. Using dynamic VT-NMR studies with designed probe compound 20, we demonstrate that the oxaborole ring undergoes rapid hydrolytic ring closing–opening at ambient temperature at a rate of >100 Hz via a mechanism featuring rate-limiting proton-transfer steps. This knowledge can help provide a better understanding of the behavior of benzoxaboroles in biological systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,411

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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