Spectral Hole Burning in Cyanobacterial Photosystem I with P700 in Oxidized and Neutral States
Notice bibliographique
Résumé
We explored the rich satellite hole structures emerging as a result of spectral hole burning in cyanobacterial photosystem I (PSI) and demonstrated that hole burning properties of PSI, particularly at high resolution, are strongly affected by the oxidation state of the primary donor P700, as P700 + effectively quenches the excitations of the lowest-energy antenna states responsible for fluorescence. Obtaining better control of this variable will be crucial for high-resolution ensemble experiments on protein energy landscapes in PSI. The separate nonphotochemical spectral hole burning (NPHB) signatures of various red antenna states were obtained, allowing for additional constraints on excitonic structure-based calculations. Preliminary evidence is presented for an additional red state of PSI of T. elongatus peaked at 712.6 nm, distinct from previously reported C708 and C715 states and possibly involving chlorophyll B15. Excitation at wavelengths as long as 800 nm results in charge separation at cryogenic temperatures in PSI also in Synechocystis sp. PCC 6803. Both the “P700 + minus P700” holes and nonphotochemical spectral holes were subjected to thermocycling. The distribution of barriers manifesting in recovery of the “P700 + minus P700” signature contains two components in sample-dependent proportions, likely reflecting the percentages of F A and F B clusters being successfully prereduced before the optical experiment. The barrier distribution for the recovery of the lower-energy nonphotochemical spectral holes resembles those observed for other pigment–protein complexes, suggesting similar structural elements are responsible for NPHB. Higher-energy components exhibit evidence of “domino effects” such as shifts of certain bands persisting past the lower-energy hole recovery. Thus, conformational changes triggered by excitation of one pigment likely can affect multiple pigments in this tightly packed system.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».