A Multi-Scale Model of the Whole Human Body based on Dynamic Parsimonious Flux Balance Analysis
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The multi-scale modelling approach is a powerful mathematical technique for simulating and analyzing complex biological systems such as the human body. This tool can help study the interactions of the various networks in a living organism, from the cellular level up to the population scale, in one framework. In this paper, a generic mathematical model is developed that describes human metabolism with 237 serum metabolites integrated with a chosen set of human metabolic networks. A new computational approach is presented for solving the resulting dynamic problem using parsimonious flux balance analysis (pFBA). To illustrate the performance of the proposed approach, the human hepatocyte genome scale model is selected for the metabolic network to be included. The simulation results show that the proposed approach has promise with respect to both computational efficiency and convergence. To demonstrate the potential application of the developed model, prediction of amino acid biomarkers for a set of inborn errors of metabolism (IEM) is considered as an example. All the simulations are performed using MATLAB and the COBRA toolbox. This framework has the potential to simulate various human metabolic disorders to help with the diagnosis of associated human diseases and to suggest novel treatment strategies. In addition, it opens the door to new opportunities for personalized medicine.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle