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Enregistrement W2522660323 · doi:10.1155/2016/8289293

The Effect of<i>Poly(ADP-ribose) Polymerase-1</i>Gene 3′Untranslated Region Polymorphism in Colorectal Cancer Risk among Saudi Cohort

2016· article· en· W2522660323 sur OpenAlexaff
Abdullah Alhadheq, Jilani P. Shaik, Abdullah Alamri, Abdulrahman Aljebreen, Othman Alharbi, Majid A. Almadi, Faten Alhadeq, Nahla Azzam, Mohammad Alanazi, Mohammad D. Bazzi, Narasimha Reddy Parine

Notice bibliographique

RevueDisease Markers · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal General Hospital
Organismes subventionnairesKing Saud University
Mots-clésColorectal cancerGenotypingSNPSingle-nucleotide polymorphismGenotypeOncologyTaqManBiologyCancer researchSNP genotypingPoly ADP ribose polymeraseMedicineInternal medicineCancerGeneGeneticsPolymerase chain reactionPolymerase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. DNA repair systems are essential for each cell to repair and maintain the genome integrity. Base excision repair pathway is one of the crucial pathways to maintain genome integrity andPARP-1plays a key role in BER pathway. The purpose of this study is to evaluate the association between polymorphisms inPARP-13′untranslated region (3′UTR) SNP rs8679 and its expression in colorectal cancer.Methods. Genotyping and gene expression were performed using TaqMan assays. The effects of age, gender, and tumor location were evaluated in cases and controls regarding the genotyping results. Resulting data was analyzed using SPSS software.Results and Conclusions. Genotyping analysis for SNP rs8679 showed decreased susceptibility to colorectal cancer at heterozygous TC allele and at minor allele C. Further this protective association was also observed in younger age patients (≤57), in female patients, and also in patients with tumors located at colon and rectum.PARP-1expression levels are significantly different in colorectal cancer compared to matched normal tissue. Our findings proved that the upregulation ofPARP-1is associated with tumor progression and poor prognosis in Saudi patients with colorectal cancer, suggesting thatPARP-1can be novel and valuable signatures for predicting the clinical outcome of patients with colorectal cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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