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Enregistrement W2522663332 · doi:10.1074/jbc.m116.741132

The Signaling Pathway of Caenorhabditis elegans Mediates Chemotaxis Response to the Attractant 2-Heptanone in a Trojan Horse-like Pathogenesis

2016· article· en· W2522663332 sur OpenAlexfundno aff
Chunmei Zhang, Ninghui Zhao, Yao Chen, Donghua Zhang, Jinyuan Yan, Wei Zou, Ke‐Qin Zhang, Xiaowei Huang

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesYunnan Provincial Science and Technology DepartmentNational Key Research and Development Program of ChinaMcMaster University
Mots-clésCaenorhabditis elegansSignal transductionBiologyCell biologyChemotaxisMutantPhospholipase CGeneBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The nematode Caenorhabditis elegans exhibits behavioral responses to a wide range of odorants associated with food and pathogens. A previous study described a Trojan Horse-like strategy of pathogenesis whereby the bacterium Bacillus nematocida B16 emits the volatile organic compound 2-heptanone to trap C. elegans for successful infection. Here, we further explored the receptor for 2-heptanone as well as the pathway involved in signal transduction in C. elegans. Our experiments showed that 2-heptanone sensing depended on the function of AWC neurons and a GPCR encoded by str-2. Consistent with the above observation, the HEK293 cells expressing STR-2 on their surfaces showed a transient elevation in intracellular Ca 2 levels after 2-heptanone applications. After combining the assays of RNA interference and gene mutants, we also identified the G subunits and their downstream components in the olfactory signal cascade that are necessary for responding to 2-heptanone, including G subunits of egl-30 and gpa-3, phospholipase C of plc-1and egl-8, and the calcium channel of cmk-1 and cal-1. Our work demonstrates for the first time that an integrated signaling pathway for 2-heptanone response in C. elegans involves recognition by GPCR STR-2, activation by G subunits of egl-30/gpa-3 and transfer to the PLC pathway, indicating that a potentially novel olfactory pathway exists in AWC neurons. Meanwhile, since 2-heptanone, a metabolite from the pathogenic bacterium B. nematocida B16, can be sensed by C. elegans and thus strongly attract its host, our current work also suggested coevolution between the pathogenic microorganism and the chemosensory system in C. elegans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,411

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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