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Enregistrement W2522866926 · doi:10.1038/srep33828

Genetic and environmental influences on the germination of basidiospores in the Cryptococcus neoformans species complex

2016· article· en· W2522866926 sur OpenAlexafffund
Adrian Forsythe, Aaron A. Vogan, Jianping Xu

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBasidiosporeBiologyGerminationCryptococcus neoformansCryptococcusSporeSpore germinationFungusBotanyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In basidiomycetous fungi, the viability of basidiospores is an important component of sexual fitness. However, relatively little is known about the genetic and environmental factors influencing basidiospore germination. In this study, we used human opportunistic yeast pathogens, Cryptococcus neoformans and Cryptococcus deneoformans, as models to investigate the potential effects of selected genetic and environmental factors on basidiospore germination. A total of five strains with known genome structure were used to construct six crosses, three of which were between strains within the same species, while the remaining three were hybrid crosses between C. neoformans and C. deneoformans. Offspring from these crosses were incubated on two media (a nutrient-limiting and a nutrient-rich) and three temperatures (23 °C, 30 °C, and 37 °C). In general, spores from intra-specific crosses had greater germination rates than those from inter-specific crosses. Of the two environmental factors, temperature showed a greater influence than nutrient medium, with the 37 °C environment yielding lower germination rates than at 23 °C and 30 °C environments in most crosses. Furthermore, there were notable interaction effects between environmental factors and parental strains or strain pairs on basidiospore germination. We discuss the implications of these results on pathogenesis and speciation in this human fungal pathogen.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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