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Enregistrement W2522993044 · doi:10.1038/nature18964

The Simons Genome Diversity Project: 300 genomes from 142 diverse populations

2016· article· en· W2522993044 sur OpenAlexaff
Swapan Mallick, Heng Li, Mark Lipson, Iain Mathieson, Melissa Gymrek, Fernando Racimo, Mengyao Zhao, Niru Chennagiri, Susanne Nordenfelt, Arti Tandon, Pontus Skoglund, Iosif Lazaridis, Sriram Sankararaman, Qiaomei Fu, Nadin Rohland, Gabriel Renaud, Yaniv Erlich, Thomas Willems, Carla Gallo, Jeffrey P. Spence, Yun S. Song, Giovanni Poletti, François Balloux, George van Driem, Peter de Knijff, Irene Gallego Romero, Aashish R. Jha, Doron M. Behar, Cláudio M. Bravi, Cristian Capelli, Tor Hervig, Andrés Moreno‐Estrada, Olga L. Posukh, Elena Balanovska, Oleg Balanovsky, Sena Karachanak-Yankova, Hovhannes Sahakyan, Драга Тончева, Levon Yepiskoposyan, Chris Tyler‐Smith, Yali Xue, Muhammad Syafiq Abdullah, Andrés Ruiz‐Linares, Cynthia M. Beall, Anna Di Rienzo, Choongwon Jeong, Elena B. Starikovskaya, Ene Metspalu, Jüri Parik, Richard Villems, Brenna M. Henn, Uğur Hodoğlugil, Robert W. Mahley, Antti Sajantila, George Stamatoyannopoulos, Joseph Wee, Р. И. Хусаинова, Э. К. Хуснутдинова, Sergey Litvinov, George Ayodo, David Comas, Michael F. Hammer, Toomas Kivisild, William Klitz, Cheryl A. Winkler, Damian Labuda, Michael J. Bamshad, Lynn B. Jorde, Sarah A. Tishkoff, W. Scott Watkins, Mait Metspalu, Stanislav Dryomov, R. I. Sukernik, Lalji Singh, Kumarasamy Thangaraj, Svante Pääbo, Janet Kelso, Nick Patterson, David Reich

Notice bibliographique

RevueNature · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueForensic and Genetic Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesSimons Foundation Autism Research InitiativeBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilTartu ÜlikoolNational Institute of Environmental Health SciencesMax-Planck-GesellschaftEuropean Regional Development FundEuropean CommissionRussian Foundation for Basic ResearchNational Center for Advancing Translational SciencesNational Human Genome Research InstituteWellcome TrustNational Institutes of HealthVetenskapsrådetEesti TeadusagentuurNational Science Foundation
Mots-clésGenome1000 Genomes ProjectEvolutionary biologyHuman genomeBiological dispersalBiologyDivergence (linguistics)IndigenousGenealogyGeographyGeneticsHistoryPopulationEcologyDemographyGeneSociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OpenAlex consigne un résumé pour ce travail, mais il n'a pas pu être récupéré à l'instant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0040,007
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0010,004
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 770
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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