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Enregistrement W2523102464 · doi:10.3389/fvets.2016.00079

Antimicrobial Susceptibility Patterns of Environmental Streptococci Recovered from Bovine Milk Samples in the Maritime Provinces of Canada

2016· article· en· W2523102464 sur OpenAlexaffabout
M. Cameron, Matthew E. Saab, Luke C. Heider, J. Trenton McClure, J.C. Rodríguez-Lecompte, Javier Sánchez

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Veterinary Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMilk Quality and Mastitis in Dairy Cows
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStreptococcus dysgalactiaeStreptococcus uberisPenicillinAntimicrobialBiologyMastitisMicrobiologyBroth microdilutionVeterinary medicineEnterococcusStreptococcus agalactiaeStreptococcusAntibioticsMinimum inhibitory concentrationMedicineBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Determination of antimicrobial susceptibility of bovine mastitis pathogens is important for guiding antimicrobial treatment decisions and for the detection of emerging resistance. Environmental streptococci are ubiquitous in the farm environment and are a frequent cause of mastitis in dairy cows. The aim of the study was to determine patterns of antimicrobial susceptibility among species of environmental streptococci isolated from dairy cows in the Maritime Provinces of Canada. The collection consisted of 192 isolates identified in milk samples collected from 177 cows originating from 18 dairy herds. Results were aggregated into: 1) Streptococcus uberis (n = 70), 2) Streptococcus dysgalactiae (n = 28), 3) other Streptococci spp. (n = 35), 4), Lactococcus spp. (n = 32), and 5) Enterococcus spp. (n = 27). Minimum inhibitory concentrations (MIC) were determined using the Sensititre microdilution system and mastitis plate format. Multilevel logistic regression models were used to analyze the data, with antimicrobial susceptibility as the outcome. The proportion of susceptible Streptococcus uberis ranged from 23% (for penicillin) to 99% (for penicillin/novobiocin), with a median of 82%. All Streptococcus dysgalactiae were susceptible to all antimicrobials except for penicillin (93% susceptible) and tetracycline (18% susceptible). The range of susceptibility for other Streptococcus spp. was 43% (for tetracycline) to 100%, with a median percent susceptibility of 92%. Lactococcus spp. isolates displayed percent susceptibilities ranging from 0% (for penicillin) to 97% (for erythromycin), median 75%. For the antimicrobials tested, the MIC were higher for Enterococcus spp. than for the other species. According to the multilevel models, there was a significant interaction between antimicrobial and bacterial species, indicating that susceptibility against a particular antimicrobial varied among the species of environmental streptococci and vice versa. Generally, susceptibility decreased with increasing within-herd average somatic cell count, isolates recovered in mid-lactation were more susceptible that isolates recovered in early lactation, and isolates recovered in samples collected post-clinical mastitis were more susceptible than isolates recovered from non-clinical lactating quarters. The results of this research support continued susceptibility of environmental streptococci to beta-lactam antimicrobials. A departure from the expected susceptibility to beta-lactams was the apparent reduced susceptibility of Streptococcus uberis to penicillin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,071

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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