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Enregistrement W2523192003 · doi:10.4254/wjh.v8.i27.1128

Implication of the intestinal microbiome in complications of cirrhosis

2016· review· en· W2523192003 sur OpenAlexaff
Mamatha Bhat, Bianca M. Arendt, Venkat Bhat, Eberhard L. Renner, Atul Humar, Johane P. Allard

Notice bibliographique

RevueWorld Journal of Hepatology · 2016
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Disease and Transplantation
Établissements canadiensUniversity of TorontoMcGill UniversityUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCirrhosisRifaximinSpontaneous bacterial peritonitisHepatic encephalopathyLactuloseGastroenterologyHepatorenal syndromeInternal medicineLiver diseaseHepatocellular carcinomaDysbiosisMicrobiomeDiseaseBioinformaticsAntibioticsMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The intestinal microbiome (IM) is altered in patients with cirrhosis, and emerging literature suggests that this impacts on the development of complications.The PubMed database was searched from January 2000 to May 2015 for studies and review articles on the composition, pathophysiologic effects and therapeutic modulation of the IM in cirrhosis.The following combination of relevant text words and MeSH terms were used, namely intestinal microbiome, microbiota, or dysbiosis, and cirrhosis, encephalopathy, spontaneous bacterial peritonitis, hepatorenal syndrome, variceal bleeding, hepatopulmonary syndrome, portopulmonary hypertension and hepatocellular carcinoma.The search results were evaluated for pertinence to the subject of IM and cirrhosis, as well as for quality of study design.The IM in cirrhosis is characterized by a decreased proportion of Bacteroides and Lactobacilli , and an increased proportion of Enterobacteriaceae compared to healthy controls.Except for alcoholic cirrhosis, the composition of the IM in cirrhosis is not affected by the etiology of the liver disease.The percentage of Enterobacteriaceae increases with worsening liver disease severity and decompensation and is associated with bacteremia, spontaneous bacterial peritonitis and hepatic encephalopathy.Lactulose, rifaximin and Lactobacillus-containing probiotics have been shown to partially reverse the cirrhosis associated enteric dysbiosis, in conjunction with improvement in encephalopathy.The IM is altered in cirrhosis, and this may contribute to the development of complications associated with end-stage liver disease.Therapies such as lactulose, rifaximin and probiotics may, at least partially, reverse the cirrhosisassociated changes in the IM.This, in turn, may prevent or alleviate the severity of complications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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