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Enregistrement W2525323356 · doi:10.1200/jco.2007.25.18_suppl.7594

Clinicopathologic features and prognostic implications of epidermal growth factor receptor (EGFR) gene mutations detected by denaturing high-performance liquid chromatography (dHPLC) in non-small cell lung cancer (NSCLC)

2007· article· en· W2525323356 sur OpenAlexaff
V. Cohen, Jason Agulnik, C. Ang, Goulnar Kasymjanova, George Chong, N. A. Tejada, Carmela Pepe, Gerald Batist, David Small, W. H. Miller

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGefitinibDenaturing high performance liquid chromatographyMedicineExonLung cancerEpidermal growth factor receptorErlotinibPoint mutationROS1MutationInternal medicineOncologyGene mutationCancer researchAdenocarcinomaCancerGeneBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

7594 Background: Somatic mutations of the EGFR gene predict sensitivity to erlotinib and gefitinib and confer a favorable prognosis in patients (pts) with NSCLC. We have recently shown that dHPLC is an efficient and more sensitive method for mutation screening compared with DNA sequencing. The goal of this study was to describe the relationship between EGFR status (mutation status and type) and clinicopathologic factors. Methods: Tumor samples were analysed for EGFR exon 19 deletions and exon 21 L858R point mutations. DNA was extracted from paraffin-embedded tumor specimens and genotyped using dHPLC. The results were correlated with gender, smoking status, pathologic subtype, disease stage, and overall survival. Results: 215 NSCLC pts were genotyped. Mutations were present in 25% of cases (54 of 215). Among pts with mutations, 70% (38 of 54) had an exon 19 mutation whereas 30% had EGFR L858R. EGFR mutations were more common in women (31% vs 14%; p=0.008), in nonsmokers than ever-smokers (54% vs 17%; p<0.001), in adenocarcinomas/BAC than with other NSCLC histologies (31% vs 11%; p=0.004) and more frequently detected in advanced-stage than in early-stage disease (36% vs 15%; p=0.001). Median survival times of pts with stage IIIB-IV disease with and without EGFR mutations were 20 and 14 months, respectively. Those with exon 19 deletion mutations had a longer median survival than pts with L858R point mutations. Data describing the impact of tyrosine kinase inhibitor therapy on survival outcomes are pending and will be presented. Conclusion: dHPLC is a reliable tool for EGFR mutation detection. Mutations were preferentially observed in women, nonsmokers, adenocarcinomas/BAC and in patients with advanced disease. Pts with mutations experienced improved survival and those harboring deletions fared better than those with point mutations. These observations warrant confirmation in large prospective trials and exploration of the biological mechanisms of the differences between mutation types. No significant financial relationships to disclose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,402
Écart entre enseignants0,374 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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