Periostin Is a Previously Uncharacterised Vitamin K Dependent γ-Carboxyglutamic Acid (Gla) Containing Protein Expressed by Marrow-Derived Mesenchymal Stromal Cells.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The modification of glutamic acid residues to g-carboxyglutamic acid (Gla) is a post-translational modification catalyzed by the vitamin K-dependent γ-glutamylcarboxylase enzyme. Despite ubiquitous expression of the γ-carboxylation machinery in mammalian tissues, only 12 Gla-containing proteins have so far been identified in humans. Because bone tissue is the second most abundant source of Gla-proteins after the liver, we sought to identify Gla proteins secreted by bone-marrow derived mesenchymal stromal cells (MSCs), a precursor to all non-hematopoietic cells in bones. We used a proteomics approach to screen the secretome of MSCs with a combination of 2D gel electrophoresis and tandem mass spectrometry. The most abundant Gla-protein secreted by MSCs was identified as periostin, a previously unrecognized γ-carboxylated protein. In silico aminoacid sequence analysis of periostin demonstrated the presence of four consensus γ-carboxylase recognition sites embedded within fasciclin-like protein domains. The carboxylation of periostin was confirmed by immunoprecipitation using anti-Gla antibodies and could be inhibited by warfarin in MSCs. In conclusion, periostin is a novel vitamin K-dependent γ-carboxylated protein distinguished from other Gla-proteins by the presence of multiple γ-carboxylase recognition sites and MSCs are an abundant source of periostin including its γ-carboxylated variant.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».