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Enregistrement W2526843003 · doi:10.1164/rccm.201602-0300oc

Genetic Modifiers of Progression-Free Survival in Never-Smoking Lung Adenocarcinoma Patients Treated with First-Line Tyrosine Kinase Inhibitors

2016· article· en· W2526843003 sur OpenAlexaff
I–Shou Chang, Shih Sheng Jiang, James Chih‐Hsin Yang, Wu‐Chou Su, Li-Hsin Chien, Chin‐Fu Hsiao, Jih‐Hsiang Lee, Chih-Yi Chen, Chung–Hsing Chen, Gee‐Chen Chang, Zhaoming Wang, Fang-Yi Lo, Kuan‐Yu Chen, Wen‐Chang Wang, Yuh‐Min Chen, Ming‐Shyan Huang, Ying‐Huang Tsai, Yu-Chun Su, Wan-Shan Hsieh, Wen-Chi Shih, Shwn‐Huey Shieh, Tsung‐Ying Yang, Qing Lan, Nathaniel Rothman, Chien-Jen Chen, Stephen J. Chanock, Pan‐Chyr Yang, Chao A. Hsiung

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Respiratory and Critical Care Medicine · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensInstitute of Population and Public HealthInstitute of Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Research Program for BiopharmaceuticalsNational Health Research InstitutesNational Science Council
Mots-clésMedicineLung cancerOncologyInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismHazard ratioEpidermal growth factor receptorAdenocarcinomaProgression-free survivalCohortTyrosine kinaseGefitinibCancer researchCancerChemotherapyGeneGenotypeReceptorBiologyGeneticsConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RATIONALE: Patients with non-small cell lung cancer (NSCLC) with mutated epidermal growth factor receptor (EGFR) are relatively sensitive to EGFR-tyrosine kinase inhibitor (TKI) treatment and have longer progression-free survival (PFS) when treated with EGFR-TKI compared with platinum-based chemotherapy. However, many patients with advanced NSCLC who have mutated EGFR do not respond to first-line EGFR-TKI treatment and still have shorter PFS. OBJECTIVES: The aim of this study was to identify genetic variants associated with PFS among patients with lung adenocarcinoma who were treated with first-line EGFR-TKIs. METHODS: A genome-wide association study on PFS was performed in never-smoking women diagnosed with lung adenocarcinoma and who were treated with first-line EGFR-TKIs (n = 128). Significant single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were selected for follow-up association analysis (n = 198) and for replication assay in another independent cohort (n = 153). MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: ) and with an estimated hazard ratio of more than 4. This association was also replicated in a larger but similar cohort and in an independent NSCLC cohort. Follow-up functional analyses showed that these SNPs were associated with the expression of EGFR, which encodes the TKI target, and with a nearby gene neuromedin-U, which encodes a G protein-coupled receptor ligand known to be involved in the progression of NSCLC. Considering these as possible prognostic biomarkers for the treatment of patients with late-stage lung cancer, we found that these SNPs were not associated with EGFR mutation status or with polymorphism of the Bcl2-interacting mediator of cell death gene. CONCLUSIONS: Genetic variants in 4q12 merit further investigation to assess their potential as pharmacogenomic predictors for and to understand the biology underlying its influence on PFS in patients treated with TKI therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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