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Enregistrement W2526966274 · doi:10.1038/nmicrobiol.2016.131

The Mouse Intestinal Bacterial Collection (miBC) provides host-specific insight into cultured diversity and functional potential of the gut microbiota

2016· article· en· W2526966274 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNature Microbiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesUniversity of North Carolina at Chapel HillCollege of Engineering, Michigan State UniversityUniversität KonstanzUniversität WienHebrew University of JerusalemUniversity of BristolInstitut Pasteur de MontevideoDeutsches Zentrum für InfektionsforschungDeutsche ForschungsgemeinschaftMichigan State University
Mots-clésHost (biology)BiologyMicrobiologyGut floraBacteriaMetagenomicsMicrobiomeEcologyImmunologyBioinformaticsGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intestinal bacteria influence mammalian physiology, but many types of bacteria are still uncharacterized. Moreover, reference strains of mouse gut bacteria are not easily available, although mouse models are extensively used in medical research. These are major limitations for the investigation of intestinal microbiomes and their interactions with diet and host. It is thus important to study in detail the diversity and functions of gut microbiota members, including those colonizing the mouse intestine. To address these issues, we aimed at establishing the Mouse Intestinal Bacterial Collection (miBC), a public repository of bacterial strains and associated genomes from the mouse gut, and studied host-specificity of colonization and sequence-based relevance of the resource. The collection includes several strains representing novel species, genera and even one family. Genomic analyses showed that certain species are specific to the mouse intestine and that a minimal consortium of 18 strains covered 50-75% of the known functional potential of metagenomes. The present work will sustain future research on microbiota-host interactions in health and disease, as it will facilitate targeted colonization and molecular studies. The resource is available at www.dsmz.de/miBC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,276
Score d'incertitude au seuil0,795

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle