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Enregistrement W2527144904 · doi:10.3996/112015-jfwm-115

Timing Moose Pellet Collections to Increase Genotyping Success of Fecal DNA

2016· article· en· W2527144904 sur OpenAlexaffabout
Roy V. Rea, Chris J. Johnson, Brent W. Murray, Dexter P. Hodder, Shannon M. Crowley

Notice bibliographique

RevueJournal of Fish and Wildlife Management · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensUniversity of Northern British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypingPelletsFecesBiologyMicrosatellitePelletPopulationZoologyGenotypeAnimal scienceEcologyGeneticsDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Fecal pellets can serve as a noninvasive source of DNA for identifying the distribution of individual animals when conducting population estimates. The quality of fecal DNA, however, can be degraded by wet or warm environmental conditions. We tested the effect of time of pellet collection (mid-March–mid-June) and temperature on the success of genotyping microsatellite loci in moose Alces alces by using DNA extracted from moose fecal pellets collected from north central British Columbia, Canada. Using the number of microsatellite loci genotyped as a measure of genotyping success clearly indicated that fecal pellets collected in March and April contained DNA that yielded high-confidence genotypes, whereas those collected in May and June did not. Pellets collected in March and April were more likely to be collected in cooler (often subzero) temperatures than those collected in May and June. Pellets collected later in the year were also more likely to be exposed to rain and increased solar radiation, all of which are likely to contribute to degradation of fecal DNA. Our findings suggest that pellets collected in late winter in the Northern Hemisphere have sufficient DNA to permit genotyping of moose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,425
Score d'incertitude au seuil0,378

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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